More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5252 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5252  amidase  100 
 
 		 446 aa  865    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3335  amidase  96.41 
 
 		 452 aa  775    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18597  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4441  amidase  81.61 
 
 		 446 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5032  amidase  96.41 
 
 		 446 aa  774    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593913 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4961  amidase  80.04 
 
 		 446 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439817  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6031  amidase  61.36 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  41.8 
 
 		 464 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0925  amidohydrolase, AtzE family  43.4 
 
 		 465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0782  amidohydrolase, AtzE family  43.4 
 
 		 465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  39.5 
 
 		 462 aa  256  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0220  amidohydrolase, AtzE family  44.1 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0928  amidase  39.78 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0873  amidase  43.18 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.753798  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0903  amidase  41.53 
 
 		 469 aa  244  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00690645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3317  amidase  39.33 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  38.53 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3473  amidase  38.88 
 
 		 465 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4656  amidase  41.94 
 
 		 482 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292034  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3028  amidase  41.29 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0772  amidase  44.19 
 
 		 472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0317505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3713  amidase  44.19 
 
 		 469 aa  232  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0721  amidase  43.06 
 
 		 475 aa  232  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0846  amidohydrolase, AtzE family  38.5 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4054  amidase  42.14 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3332  amidase  38.88 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3453  amidase  38.88 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3194  amidase  38.88 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0653  amidase  43.36 
 
 		 466 aa  222  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2012  amidase  41.31 
 
 		 471 aa  223  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0494879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1693  amidase  41.22 
 
 		 471 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.070698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2141  amidase  41.96 
 
 		 461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0408812  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1654  amidase  43 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838482  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1125  amidase  39.87 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0767616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  30.72 
 
 		 470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.3 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.77 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.88 
 
 		 475 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.49 
 
 		 463 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  37.22 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  34.64 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.2 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  33.69 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0638  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.21 
 
 		 494 aa  169  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.77 
 
 		 485 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  33.86 
 
 		 447 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  34.3 
 
 		 463 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl162  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.1 
 
 		 482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.48 
 
 		 486 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  33.56 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  33.63 
 
 		 458 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.72 
 
 		 486 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.66 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6767  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  36.36 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.26 
 
 		 487 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.71 
 
 		 489 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  38.46 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15821  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.4 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  34.08 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.47 
 
 		 487 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.05 
 
 		 485 aa  156  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  34.33 
 
 		 457 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.22 
 
 		 488 aa  156  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2341  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.25 
 
 		 485 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  33.12 
 
 		 499 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1591  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.63 
 
 		 488 aa  155  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1115  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.19 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00160205  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7392  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.5 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.02 
 
 		 491 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.74 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.14 
 
 		 486 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.93 
 
 		 486 aa  153  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.8 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4434  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  30.39 
 
 		 486 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.689377  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0208  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.382536  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  31.91 
 
 		 456 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.01 
 
 		 482 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.28 
 
 		 491 aa  149  7e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  35.76 
 
 		 470 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  29.06 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.63 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.22 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.35 
 
 		 484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  33.72 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0367  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.9 
 
 		 485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4953  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.9 
 
 		 485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  32.89 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0350  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.9 
 
 		 485 aa  147  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0306  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.9 
 
 		 485 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.9 
 
 		 485 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0321  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.9 
 
 		 485 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.8 
 
 		 486 aa  147  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3870  2-alkenal reductase  37.22 
 
 		 454 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.80719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  30.28 
 
 		 472 aa  147  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0394  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.9 
 
 		 485 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0353  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.9 
 
 		 485 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0827  Amidase  32.68 
 
 		 470 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0223449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0289  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.9 
 
 		 485 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.83 
 
 		 479 aa  146  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  32.96 
 
 		 449 aa  146  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  32.88 
 
 		 482 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>