More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5032 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5252  amidase  96.41 
 
 		 446 aa  775    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3335  amidase  100 
 
 		 452 aa  865    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18597  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4441  amidase  82.06 
 
 		 446 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5032  amidase  100 
 
 		 446 aa  865    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593913 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4961  amidase  80.04 
 
 		 446 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439817  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6031  amidase  61.09 
 
 		 449 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  42.02 
 
 		 464 aa  286  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0782  amidohydrolase, AtzE family  43.4 
 
 		 465 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0925  amidohydrolase, AtzE family  43.4 
 
 		 465 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  40.32 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0220  amidohydrolase, AtzE family  44.1 
 
 		 454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  38.98 
 
 		 457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0928  amidase  40.05 
 
 		 466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3317  amidase  40.23 
 
 		 468 aa  243  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0873  amidase  43.44 
 
 		 470 aa  243  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.753798  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4656  amidase  42.96 
 
 		 482 aa  242  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292034  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0903  amidase  41.32 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00690645  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0772  amidase  45.12 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0317505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3473  amidase  39.68 
 
 		 465 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3028  amidase  41.74 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3713  amidase  44.44 
 
 		 469 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0846  amidohydrolase, AtzE family  39.26 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0721  amidase  42.82 
 
 		 475 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2012  amidase  41.76 
 
 		 471 aa  226  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0494879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4054  amidase  42.14 
 
 		 467 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1693  amidase  41.67 
 
 		 471 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.070698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0653  amidase  43.6 
 
 		 466 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3332  amidase  39.45 
 
 		 465 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3194  amidase  39.45 
 
 		 465 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3453  amidase  39.45 
 
 		 465 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1654  amidase  43.73 
 
 		 458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2141  amidase  41.96 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0408812  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1125  amidase  40.09 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0767616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  31 
 
 		 470 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.74 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.55 
 
 		 461 aa  189  7e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.86 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  35.03 
 
 		 476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.61 
 
 		 475 aa  173  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  37.28 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.97 
 
 		 475 aa  171  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  34.53 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  34.3 
 
 		 447 aa  170  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  34.52 
 
 		 463 aa  166  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  33.86 
 
 		 458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.69 
 
 		 487 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.76 
 
 		 485 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.3 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  37.01 
 
 		 445 aa  161  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.77 
 
 		 486 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  34.3 
 
 		 463 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.38 
 
 		 485 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0638  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.22 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  33.41 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15821  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.54 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.85 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.88 
 
 		 488 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.29 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6767  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  36.01 
 
 		 501 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl162  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.68 
 
 		 482 aa  157  4e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.78 
 
 		 491 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.68 
 
 		 485 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1591  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.91 
 
 		 488 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  34.34 
 
 		 457 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  32.87 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  32.9 
 
 		 499 aa  153  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7392  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.5 
 
 		 451 aa  153  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.72 
 
 		 486 aa  153  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.77 
 
 		 487 aa  153  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.51 
 
 		 486 aa  153  8e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  34.32 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.51 
 
 		 480 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.77 
 
 		 491 aa  151  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1115  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.55 
 
 		 485 aa  150  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00160205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.01 
 
 		 482 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4434  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  30.17 
 
 		 486 aa  150  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.689377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.74 
 
 		 486 aa  149  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  34.76 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.74 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2341  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.2 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  32.96 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  34.8 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.83 
 
 		 479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0208  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.93 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.382536  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  36.98 
 
 		 403 aa  147  5e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  35.51 
 
 		 405 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  32.3 
 
 		 450 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  30.43 
 
 		 466 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  28.63 
 
 		 477 aa  147  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0068  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.03 
 
 		 474 aa  146  8.000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000049622 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  32.37 
 
 		 459 aa  146  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  37.93 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  33.79 
 
 		 449 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.66 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.97 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1297  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.64 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  32.96 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  35.1 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  33.69 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.56 
 
 		 479 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>