More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0721 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1654  amidase  80.48 
 
 
458 aa  639    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838482  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4054  amidase  80 
 
 
467 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200253  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0721  amidase  100 
 
 
475 aa  943    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0653  amidase  68.93 
 
 
466 aa  565  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4656  amidase  67.11 
 
 
482 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292034  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2141  amidase  69.03 
 
 
461 aa  554  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0408812  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2012  amidase  66.52 
 
 
471 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0494879  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1693  amidase  66.74 
 
 
471 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.070698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1125  amidase  65.87 
 
 
471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0767616  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  57.05 
 
 
464 aa  495  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0782  amidohydrolase, AtzE family  59.87 
 
 
465 aa  487  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0925  amidohydrolase, AtzE family  59.87 
 
 
465 aa  487  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3028  amidase  58.55 
 
 
467 aa  481  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0772  amidase  60.09 
 
 
472 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0317505  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  54.24 
 
 
462 aa  464  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  52.91 
 
 
457 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0846  amidohydrolase, AtzE family  53.28 
 
 
464 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0928  amidase  50.88 
 
 
466 aa  425  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3713  amidase  57.93 
 
 
469 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3473  amidase  52.75 
 
 
465 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3317  amidase  51.83 
 
 
468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0903  amidase  50.99 
 
 
469 aa  405  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00690645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3453  amidase  48.9 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3194  amidase  48.9 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3332  amidase  48.9 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0873  amidase  49.46 
 
 
470 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.753798  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0220  amidohydrolase, AtzE family  48.11 
 
 
454 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  40.04 
 
 
463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  37.72 
 
 
470 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  36.95 
 
 
470 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5252  amidase  43.55 
 
 
446 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  39.74 
 
 
463 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3335  amidase  43.25 
 
 
452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18597  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5032  amidase  43.42 
 
 
446 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  39.22 
 
 
471 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  42.42 
 
 
473 aa  249  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4961  amidase  41.31 
 
 
446 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439817  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6031  amidase  40.26 
 
 
449 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.66 
 
 
480 aa  246  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4441  amidase  41.76 
 
 
446 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  39.11 
 
 
461 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0827  Amidase  38.73 
 
 
470 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0223449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7145  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  36.54 
 
 
470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0220  amidase  37.47 
 
 
471 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855119  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0638  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.53 
 
 
494 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12630  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  38.93 
 
 
483 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  35.97 
 
 
487 aa  231  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  37.74 
 
 
484 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  37.55 
 
 
499 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.25 
 
 
491 aa  227  3e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.9 
 
 
485 aa  227  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.79 
 
 
485 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.49 
 
 
498 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.89 
 
 
485 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.62 
 
 
475 aa  223  8e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  36.66 
 
 
461 aa  223  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  31.16 
 
 
486 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5097  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.48 
 
 
484 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32 
 
 
486 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4474  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  36.07 
 
 
483 aa  220  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  36.33 
 
 
512 aa  220  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58180  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.27 
 
 
484 aa  220  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2730  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  36.17 
 
 
485 aa  220  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0351101  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0068  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.74 
 
 
474 aa  219  7e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000049622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3088  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.6 
 
 
485 aa  219  7e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00014479  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15821  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.72 
 
 
486 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.96 
 
 
485 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.85 
 
 
491 aa  219  8.999999999999998e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4165  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.27 
 
 
483 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.01 
 
 
487 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1245  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  37.58 
 
 
490 aa  218  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0989  amidase  36.22 
 
 
470 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.4 
 
 
494 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.96 
 
 
485 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0518  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.6 
 
 
483 aa  216  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.436865  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1650  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.6 
 
 
483 aa  216  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000758087  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.55 
 
 
486 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.38 
 
 
483 aa  216  8e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.47 
 
 
485 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.89 
 
 
485 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0836  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.5 
 
 
483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0318775  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0854  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.48 
 
 
483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4338  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  38.01 
 
 
490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.55 
 
 
484 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.47 
 
 
482 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.31 
 
 
489 aa  214  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.92 
 
 
489 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.4 
 
 
486 aa  213  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3559  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  38 
 
 
498 aa  213  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0332  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  38.03 
 
 
483 aa  213  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124108  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  35.9 
 
 
470 aa  213  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.06 
 
 
488 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.23 
 
 
486 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1700  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.91 
 
 
483 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  38.12 
 
 
508 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.33 
 
 
505 aa  211  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1701  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.91 
 
 
483 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.1 
 
 
486 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  37.15 
 
 
495 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2636  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.89 
 
 
483 aa  210  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>