More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2988 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  100 
 
 		 445 aa  869    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  30.53 
 
 		 470 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  35.68 
 
 		 463 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  34.17 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  35.16 
 
 		 432 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.09 
 
 		 479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  35.08 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  30.92 
 
 		 475 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  28.7 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.81 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1917  hypothetical protein  30.11 
 
 		 494 aa  157  4e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.32 
 
 		 499 aa  157  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.42 
 
 		 475 aa  156  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3208  amidase  33.79 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  32.05 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.24 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5981  amidase  33.88 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0693963  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.64 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.41 
 
 		 483 aa  155  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  35.02 
 
 		 466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  30.79 
 
 		 480 aa  154  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  33.57 
 
 		 461 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  33.48 
 
 		 462 aa  153  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  48.66 
 
 		 473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  32.82 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  33.77 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.33 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5068  amidase  30.7 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.408041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0402  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.07 
 
 		 477 aa  152  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0325637  hitchhiker  0.0000425632 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.88 
 
 		 486 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  32.11 
 
 		 549 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.57 
 
 		 498 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0873  amidase  34.84 
 
 		 470 aa  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.753798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  33.95 
 
 		 463 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2453  amidase  35.53 
 
 		 467 aa  149  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.205936  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1701  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.48 
 
 		 483 aa  149  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.54 
 
 		 486 aa  149  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  37.14 
 
 		 395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  34.84 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1700  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.48 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  34.33 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  35.36 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  32.47 
 
 		 476 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0903  amidase  34.68 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00690645  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2379  amidase  33.33 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.732012  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4838  Amidase  31.21 
 
 		 469 aa  147  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2838  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.71 
 
 		 501 aa  147  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09141  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.14 
 
 		 482 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  34.85 
 
 		 495 aa  146  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.22 
 
 		 485 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4787  Amidase  37.1 
 
 		 516 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.16 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0237  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 		 500 aa  145  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.780008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0399  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.11 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  31.51 
 
 		 600 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.18 
 
 		 481 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0353  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.82 
 
 		 485 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0306  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.82 
 
 		 485 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0321  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.82 
 
 		 485 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.73 
 
 		 485 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0350  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.03 
 
 		 485 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0394  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.03 
 
 		 485 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09121  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.72 
 
 		 482 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2896  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.41 
 
 		 488 aa  143  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.03 
 
 		 485 aa  143  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  32.24 
 
 		 466 aa  143  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0853  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.05 
 
 		 480 aa  143  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.27 
 
 		 486 aa  143  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12389  amidase  34.62 
 
 		 484 aa  142  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.232492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  31.14 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.79 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  34.8 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.14 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  31.39 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0231  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.48 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.747986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.2 
 
 		 485 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.41 
 
 		 485 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10291  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.48 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.484565  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.13 
 
 		 479 aa  141  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0465  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.18 
 
 		 474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3274  Amidase  32.96 
 
 		 459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201611  normal  0.0653663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0928  amidase  32.02 
 
 		 466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4188  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.86 
 
 		 492 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.834018  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0436  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.82 
 
 		 477 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.194973 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.72 
 
 		 494 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4296  amidase  35.59 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.581919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.04 
 
 		 491 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0756  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.28 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.61 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  30.98 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3317  amidase  31.5 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  32.89 
 
 		 599 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.15 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2205  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.45 
 
 		 499 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2065  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.75 
 
 		 485 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.700676 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4338  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.54 
 
 		 490 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.07 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  32.9 
 
 		 601 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0085  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.04 
 
 		 496 aa  137  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13411  amidase amiD (acylamidase)  30.3 
 
 		 475 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>