More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0849 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0849  amidase  100 
 
 		 457 aa  878    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  66.89 
 
 		 452 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  65.93 
 
 		 448 aa  482  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  63.88 
 
 		 440 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  67.32 
 
 		 453 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  63.74 
 
 		 440 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  52.97 
 
 		 456 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  50.89 
 
 		 449 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  51.11 
 
 		 463 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  54.85 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  52.33 
 
 		 449 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  52.9 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  51.64 
 
 		 449 aa  378  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  51.25 
 
 		 449 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  51.99 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  51.21 
 
 		 447 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  50 
 
 		 450 aa  360  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  54.55 
 
 		 457 aa  359  5e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  49.67 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  55.34 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  57.01 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  56.56 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  57.34 
 
 		 458 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  57.08 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  57.08 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  57.08 
 
 		 616 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  57.08 
 
 		 472 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  57.08 
 
 		 472 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  57.08 
 
 		 616 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  57.08 
 
 		 616 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  51.6 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  56.79 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  57.11 
 
 		 459 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  55.2 
 
 		 458 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  55.2 
 
 		 458 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  54.69 
 
 		 450 aa  342  7e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  49.01 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  55.43 
 
 		 458 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  49.34 
 
 		 450 aa  325  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  56.21 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  55.2 
 
 		 458 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  45.39 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  52.97 
 
 		 453 aa  310  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  47.25 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  51.37 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  45.47 
 
 		 453 aa  292  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  46.53 
 
 		 456 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  48.4 
 
 		 469 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  50.86 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  50.86 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  47.2 
 
 		 413 aa  288  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  50.79 
 
 		 427 aa  286  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  44.65 
 
 		 423 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  46.06 
 
 		 457 aa  260  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  51.31 
 
 		 435 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  40.94 
 
 		 452 aa  243  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  44.33 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  40.1 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  44.76 
 
 		 435 aa  237  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  43.81 
 
 		 446 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  52.09 
 
 		 427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  42.07 
 
 		 457 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  42.61 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  43.83 
 
 		 465 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  43.57 
 
 		 436 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  42.6 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  43.83 
 
 		 441 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  43.41 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  40.19 
 
 		 440 aa  213  7.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  37.08 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  33.76 
 
 		 466 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  39.61 
 
 		 458 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  38.88 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  41.82 
 
 		 441 aa  199  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  37.69 
 
 		 463 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2093  hypothetical protein  44.07 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  34.73 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  38.66 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  38.06 
 
 		 443 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0061  amidase  40.38 
 
 		 443 aa  189  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222867  hitchhiker  0.0000105372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  36.07 
 
 		 471 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  33.62 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  35.27 
 
 		 454 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  33.91 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0220  amidase  35.85 
 
 		 471 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  37.5 
 
 		 468 aa  187  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  35.6 
 
 		 463 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.91 
 
 		 470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  31.37 
 
 		 470 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.85 
 
 		 461 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0327  amidase  42.34 
 
 		 422 aa  183  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  36.46 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  36.9 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.32 
 
 		 480 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0782  amidohydrolase, AtzE family  35.13 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0925  amidohydrolase, AtzE family  35.13 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0827  Amidase  35.78 
 
 		 470 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0223449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4364  amidase  36.56 
 
 		 471 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000480403  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4296  amidase  38.79 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.581919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  33.12 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>