More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2771 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2771  amidase  100 
 
 		 453 aa  875    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  63.76 
 
 		 463 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  62.47 
 
 		 449 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  63.15 
 
 		 449 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  61.16 
 
 		 449 aa  494  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  59.73 
 
 		 450 aa  481  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  61.16 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  61.86 
 
 		 449 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  62.53 
 
 		 447 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  51.57 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  54.21 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  54.55 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  51.36 
 
 		 449 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  50.79 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  52.62 
 
 		 448 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  53.63 
 
 		 457 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  51.76 
 
 		 462 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  51.12 
 
 		 452 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  54.02 
 
 		 472 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  54.02 
 
 		 472 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  54.02 
 
 		 458 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  53.81 
 
 		 476 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  54.02 
 
 		 458 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  53.32 
 
 		 457 aa  360  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  54.02 
 
 		 616 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  54.02 
 
 		 616 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  54.02 
 
 		 616 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  52.19 
 
 		 453 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  51.95 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  51.26 
 
 		 458 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  51.26 
 
 		 458 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  52.8 
 
 		 450 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  51.95 
 
 		 458 aa  349  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  52.18 
 
 		 458 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  52.18 
 
 		 459 aa  339  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  52.18 
 
 		 458 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  47.65 
 
 		 457 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  51.49 
 
 		 458 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  47.97 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  45.09 
 
 		 469 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  49.49 
 
 		 441 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  48.4 
 
 		 448 aa  316  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  49.89 
 
 		 481 aa  315  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  51.97 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  45.96 
 
 		 451 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  48.4 
 
 		 448 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  43.18 
 
 		 459 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  45.07 
 
 		 413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  44.77 
 
 		 457 aa  282  8.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  43.63 
 
 		 456 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  47.55 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  41.14 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  41.8 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  42.04 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  39.58 
 
 		 423 aa  246  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  42.45 
 
 		 446 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  49.06 
 
 		 435 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  42.45 
 
 		 446 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  36.95 
 
 		 443 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  39.78 
 
 		 457 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  41.11 
 
 		 442 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  37.83 
 
 		 452 aa  229  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  42.71 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  38.95 
 
 		 443 aa  226  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  43.65 
 
 		 435 aa  223  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  38.62 
 
 		 437 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  39.23 
 
 		 465 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  36.15 
 
 		 447 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  47.1 
 
 		 427 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  40.32 
 
 		 436 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  40.32 
 
 		 441 aa  203  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  38.34 
 
 		 432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  41.55 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  40.21 
 
 		 460 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  36.99 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  33.33 
 
 		 464 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.22 
 
 		 467 aa  177  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0061  amidase  40.11 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222867  hitchhiker  0.0000105372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.13 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.23 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  37.03 
 
 		 458 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  38.5 
 
 		 463 aa  169  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0327  amidase  39.38 
 
 		 422 aa  162  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  35.96 
 
 		 454 aa  162  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  29.22 
 
 		 470 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  35.26 
 
 		 467 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7145  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.97 
 
 		 470 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2027  Amidase  38.69 
 
 		 475 aa  160  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36 
 
 		 463 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  35.26 
 
 		 467 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  37.02 
 
 		 467 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  37.02 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  37.02 
 
 		 467 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  31.72 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  37.02 
 
 		 467 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  36.78 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0220  amidase  33.69 
 
 		 471 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0989  amidase  36.68 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2093  hypothetical protein  37.33 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>