More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4204 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  100 
 
 		 442 aa  876    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  89.14 
 
 		 457 aa  753    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2093  hypothetical protein  49.23 
 
 		 477 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598821 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  46.23 
 
 		 456 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  44.87 
 
 		 447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  45.43 
 
 		 459 aa  339  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  44.98 
 
 		 456 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  45.39 
 
 		 453 aa  312  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2027  Amidase  45.48 
 
 		 475 aa  259  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  38.88 
 
 		 457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  37.82 
 
 		 463 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  40.74 
 
 		 469 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  40.26 
 
 		 449 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  40.09 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  41.12 
 
 		 450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  39.28 
 
 		 449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  37.61 
 
 		 449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  38.03 
 
 		 447 aa  233  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  38.92 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  39.14 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  41.69 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  38.5 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  38.67 
 
 		 437 aa  223  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  40.26 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  38.7 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  38.8 
 
 		 450 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  37.89 
 
 		 447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  43.58 
 
 		 427 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  39.55 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  35.27 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  39.3 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  43.3 
 
 		 448 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0327  amidase  39.68 
 
 		 422 aa  213  7e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  39.07 
 
 		 440 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  39.44 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  42.61 
 
 		 457 aa  209  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  40.09 
 
 		 452 aa  209  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  37.81 
 
 		 465 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  40.54 
 
 		 453 aa  203  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  35.66 
 
 		 423 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  41.37 
 
 		 453 aa  201  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  36.16 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  38.31 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  38.31 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  41.35 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  38.46 
 
 		 413 aa  195  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  37.56 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  34.5 
 
 		 452 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  36.12 
 
 		 407 aa  187  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  35.38 
 
 		 443 aa  186  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  38.12 
 
 		 448 aa  186  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  40.2 
 
 		 476 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  38.12 
 
 		 448 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  40.51 
 
 		 458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  40.55 
 
 		 458 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  40.55 
 
 		 458 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  40.55 
 
 		 458 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  35.18 
 
 		 443 aa  179  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  40.55 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  40.35 
 
 		 458 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  37.42 
 
 		 462 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  39.69 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  39.69 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  39.69 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  39.69 
 
 		 616 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  39.69 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  39.69 
 
 		 616 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  39.69 
 
 		 616 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  32.68 
 
 		 457 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0061  amidase  35.05 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222867  hitchhiker  0.0000105372 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  34.86 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  40.36 
 
 		 458 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  34.88 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  40.89 
 
 		 459 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  36.52 
 
 		 458 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  31.42 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  30.65 
 
 		 470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  33.73 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  41.2 
 
 		 427 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  39.9 
 
 		 481 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  33.56 
 
 		 468 aa  156  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  34.29 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  35.45 
 
 		 435 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  31.06 
 
 		 462 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4656  amidase  33.12 
 
 		 482 aa  150  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292034  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  34.75 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3317  amidase  33.03 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.94 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  32.35 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  30.52 
 
 		 474 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  33.41 
 
 		 461 aa  146  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  29.96 
 
 		 464 aa  146  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  31.65 
 
 		 471 aa  146  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  31.52 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  32.13 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  33.93 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  33.02 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0782  amidohydrolase, AtzE family  33.63 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  32.04 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0925  amidohydrolase, AtzE family  33.63 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>