More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2093 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2093  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  942    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  49.23 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  47.98 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  44.16 
 
 		 459 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  43.94 
 
 		 456 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  44.78 
 
 		 456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  43.54 
 
 		 447 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  44.5 
 
 		 453 aa  286  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  37.56 
 
 		 456 aa  226  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  44.31 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  38.7 
 
 		 463 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  37.42 
 
 		 440 aa  212  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0327  amidase  43.32 
 
 		 422 aa  210  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  37.33 
 
 		 449 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  37.86 
 
 		 450 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  37.74 
 
 		 451 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  41.88 
 
 		 427 aa  206  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  39.85 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  38.66 
 
 		 450 aa  204  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  40.6 
 
 		 449 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  37.87 
 
 		 457 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  36.84 
 
 		 447 aa  200  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  36.84 
 
 		 449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  38.55 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  37.9 
 
 		 437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  36.2 
 
 		 449 aa  196  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  37.62 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  35.41 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  37.59 
 
 		 449 aa  195  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  36.21 
 
 		 465 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  36.95 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  37.99 
 
 		 440 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  36.45 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2027  Amidase  41.4 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  37.76 
 
 		 436 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  39.58 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  41 
 
 		 453 aa  187  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  37.53 
 
 		 441 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  36.26 
 
 		 451 aa  186  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  36.85 
 
 		 413 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  43.36 
 
 		 435 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  39.6 
 
 		 448 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  37.12 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  35.32 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  39.44 
 
 		 458 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0061  amidase  36.64 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222867  hitchhiker  0.0000105372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  37.28 
 
 		 452 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  40.49 
 
 		 476 aa  171  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  39.53 
 
 		 458 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  40.47 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  39.3 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  37.88 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  37.88 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  36.36 
 
 		 458 aa  166  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  38.57 
 
 		 459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  39.51 
 
 		 616 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  39.42 
 
 		 458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  39.51 
 
 		 616 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  39.42 
 
 		 458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  39.51 
 
 		 616 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  35.43 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  39.42 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  39.42 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  33.83 
 
 		 443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  35.7 
 
 		 460 aa  163  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  34.01 
 
 		 441 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  34.35 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  39.39 
 
 		 458 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  34.48 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  33.33 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  38.75 
 
 		 458 aa  156  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  43.71 
 
 		 427 aa  154  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  37.59 
 
 		 462 aa  153  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  38.57 
 
 		 481 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  33.84 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  36.48 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  31.17 
 
 		 471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  33.55 
 
 		 473 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  31.97 
 
 		 474 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  31.6 
 
 		 549 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0163  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.98 
 
 		 499 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  25.66 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  30.88 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  30.99 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  27.8 
 
 		 464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  34.89 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.7 
 
 		 475 aa  131  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.08 
 
 		 495 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  33.47 
 
 		 447 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  32.4 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4364  amidase  33.26 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000480403  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3559  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.21 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.22 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8074  Amidase  31.31 
 
 		 496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2394  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.29 
 
 		 516 aa  128  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.225489  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  32.8 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4656  amidase  32.77 
 
 		 482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292034  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2379  amidase  31.26 
 
 		 480 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.732012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  34.47 
 
 		 468 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3436  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.87 
 
 		 506 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>