More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0543 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  86.24 
 
 		 616 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  86.24 
 
 		 458 aa  693    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  84.46 
 
 		 459 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  95.2 
 
 		 458 aa  746    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  86.24 
 
 		 472 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  97.38 
 
 		 458 aa  758    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  86.24 
 
 		 472 aa  693    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  86.24 
 
 		 616 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  93.45 
 
 		 458 aa  739    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  85.59 
 
 		 476 aa  690    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  81.94 
 
 		 462 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  100 
 
 		 458 aa  898    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  86.24 
 
 		 458 aa  693    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  94.98 
 
 		 458 aa  765    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  100 
 
 		 458 aa  898    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  99.13 
 
 		 458 aa  888    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  86.24 
 
 		 616 aa  694    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  85.12 
 
 		 481 aa  631  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  52.98 
 
 		 463 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  56.54 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  53.54 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  52.75 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  51.95 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  54.18 
 
 		 440 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  53.55 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  52.63 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  54.97 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  55.04 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  52.63 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  53.12 
 
 		 440 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  50.67 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  55.81 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  51.95 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  51.61 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  50.78 
 
 		 447 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  51.33 
 
 		 451 aa  359  7e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  51.7 
 
 		 457 aa  349  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  54.29 
 
 		 457 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  52.88 
 
 		 450 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  48.99 
 
 		 457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  49.45 
 
 		 450 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  46.95 
 
 		 469 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  51.78 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  48.12 
 
 		 448 aa  317  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  48.34 
 
 		 448 aa  316  5e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  46.72 
 
 		 413 aa  312  7.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  48.92 
 
 		 441 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  43.21 
 
 		 456 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  42.22 
 
 		 459 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  42.38 
 
 		 457 aa  279  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  42 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  42.31 
 
 		 423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  42.75 
 
 		 452 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  42.79 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  45.5 
 
 		 427 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  42.16 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  42.16 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  41.18 
 
 		 437 aa  233  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  47.38 
 
 		 435 aa  229  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  38.79 
 
 		 443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  47.94 
 
 		 427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  36.4 
 
 		 447 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  36.66 
 
 		 440 aa  219  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  39.16 
 
 		 457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  40.3 
 
 		 451 aa  212  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  39.14 
 
 		 407 aa  212  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  40.55 
 
 		 442 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  40.62 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  36.91 
 
 		 432 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  38 
 
 		 443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  40.35 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  31.6 
 
 		 470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.6 
 
 		 470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  33.69 
 
 		 549 aa  189  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36.87 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.37 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  33.91 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0989  amidase  33.7 
 
 		 470 aa  186  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  36.32 
 
 		 468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  32.03 
 
 		 464 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  37.09 
 
 		 465 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.1 
 
 		 463 aa  179  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  35.84 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  34.74 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  36.24 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0220  amidase  34.92 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  29.39 
 
 		 486 aa  176  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  39.18 
 
 		 441 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1307  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.13 
 
 		 525 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0827  Amidase  34.29 
 
 		 470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0223449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.56 
 
 		 512 aa  173  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  33.41 
 
 		 471 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4656  amidase  33.04 
 
 		 482 aa  173  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292034  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.12 
 
 		 489 aa  173  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.64 
 
 		 508 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.39 
 
 		 486 aa  172  9e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  38.5 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.4 
 
 		 485 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.51 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.6 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>