More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0715 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  81.24 
 
 		 458 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  81.24 
 
 		 616 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  81.24 
 
 		 458 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  81.24 
 
 		 472 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  84.31 
 
 		 459 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  100 
 
 		 462 aa  906    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  81.02 
 
 		 476 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  84.53 
 
 		 481 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  81.24 
 
 		 472 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  81.94 
 
 		 458 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  81.24 
 
 		 616 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  81.72 
 
 		 458 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  81.94 
 
 		 458 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  81.24 
 
 		 616 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  81.5 
 
 		 458 aa  634  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  81.72 
 
 		 458 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  81.94 
 
 		 458 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  81.94 
 
 		 458 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  56.44 
 
 		 447 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  51.66 
 
 		 463 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  52.89 
 
 		 456 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  52.67 
 
 		 449 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  51.38 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  53.9 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  53.09 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  52.86 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  52.38 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  53.62 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  53.57 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  50.22 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  50.22 
 
 		 447 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  53.66 
 
 		 448 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  53.66 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  52.86 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  49.89 
 
 		 449 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  53.88 
 
 		 453 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  54.68 
 
 		 457 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  52.49 
 
 		 450 aa  355  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  49.67 
 
 		 451 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  50 
 
 		 450 aa  343  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  47.52 
 
 		 457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  51.54 
 
 		 453 aa  329  8e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  47.23 
 
 		 413 aa  326  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  48.34 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  48.34 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  45.48 
 
 		 469 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  46.05 
 
 		 441 aa  306  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  43.24 
 
 		 456 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  41.56 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  41.91 
 
 		 457 aa  276  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  41.06 
 
 		 456 aa  266  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  41.84 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  40.1 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  43.51 
 
 		 437 aa  257  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  42.01 
 
 		 453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  45.29 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  42.31 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  42.6 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  39.45 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  46.59 
 
 		 435 aa  225  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  49.66 
 
 		 427 aa  219  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  38.39 
 
 		 443 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  41.12 
 
 		 451 aa  216  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  36.81 
 
 		 457 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  39.09 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  35.21 
 
 		 447 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  35.65 
 
 		 440 aa  206  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  38.75 
 
 		 443 aa  206  9e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  40.41 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  34.83 
 
 		 432 aa  200  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  39.85 
 
 		 460 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  37.23 
 
 		 454 aa  189  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.37 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  32.03 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36.5 
 
 		 463 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  36.04 
 
 		 463 aa  183  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  32.54 
 
 		 549 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  35.04 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.62 
 
 		 467 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  31.21 
 
 		 464 aa  180  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  29.72 
 
 		 470 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  28.66 
 
 		 470 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.31 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2027  Amidase  40.31 
 
 		 475 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  29.85 
 
 		 486 aa  176  8e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  35.6 
 
 		 473 aa  176  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7145  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.2 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.12 
 
 		 485 aa  173  6.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  36.26 
 
 		 465 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.85 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0827  Amidase  33.41 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0223449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0220  amidase  33.48 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  39.35 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.16 
 
 		 479 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4656  amidase  33.91 
 
 		 482 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292034  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  33.92 
 
 		 447 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  32.25 
 
 		 471 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  34.67 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.54 
 
 		 489 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.93 
 
 		 485 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>