More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3744 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3744  amidase  100 
 
 		 427 aa  830    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  77.93 
 
 		 435 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  65.19 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  54.76 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  55.32 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  49.15 
 
 		 407 aa  332  5e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  47.99 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  45.79 
 
 		 449 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  48.34 
 
 		 449 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  44.94 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  46.65 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  45.15 
 
 		 452 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  46.88 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  46.88 
 
 		 449 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  47.1 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  46.73 
 
 		 449 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  47.2 
 
 		 453 aa  294  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  48.82 
 
 		 457 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  45.01 
 
 		 457 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  47.35 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  48.56 
 
 		 451 aa  289  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  47.32 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  44.5 
 
 		 447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  44.72 
 
 		 450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  50.25 
 
 		 457 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  45.95 
 
 		 447 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  43.98 
 
 		 469 aa  279  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  41.63 
 
 		 459 aa  279  7e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  44.02 
 
 		 456 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  41.1 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  47.78 
 
 		 450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  44.55 
 
 		 413 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  43.99 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  44.55 
 
 		 449 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  46.95 
 
 		 448 aa  264  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  43.22 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  48.98 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  43.71 
 
 		 448 aa  257  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  43.48 
 
 		 448 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  44.39 
 
 		 462 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  46.84 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  48.17 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  42.63 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  45.86 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  43.88 
 
 		 442 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  44.92 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  44.92 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  46.88 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  46.88 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  46.88 
 
 		 616 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  46.88 
 
 		 472 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  46.88 
 
 		 472 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  46.88 
 
 		 616 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  46.88 
 
 		 616 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  47.38 
 
 		 476 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  45.86 
 
 		 458 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  41.86 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  43.08 
 
 		 451 aa  232  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  44.92 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  46.87 
 
 		 458 aa  229  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  43.54 
 
 		 459 aa  226  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  45.66 
 
 		 458 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  41.3 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  36.27 
 
 		 447 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  42.82 
 
 		 441 aa  216  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  39.59 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  39.43 
 
 		 446 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  43.64 
 
 		 481 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  37.75 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  40.29 
 
 		 441 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2093  hypothetical protein  41.82 
 
 		 477 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  39.86 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  36.52 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  35.47 
 
 		 467 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  38.24 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2027  Amidase  41.22 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  38.55 
 
 		 458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  37.88 
 
 		 454 aa  183  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  36.76 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  37.01 
 
 		 460 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  36.66 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  39.65 
 
 		 416 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  36.6 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0061  amidase  39.18 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222867  hitchhiker  0.0000105372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4393  amidase  38.82 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  36.58 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  35.22 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  33.26 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0327  amidase  41.43 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  38.05 
 
 		 546 aa  171  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.22 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  31.99 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  34.52 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0638  amidase  35.98 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.921571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  36.05 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  36.52 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  32.32 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0989  amidase  34.52 
 
 		 470 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  34.83 
 
 		 400 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  36.52 
 
 		 467 aa  166  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>