More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2055 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2055  amidase  100 
 
 		 405 aa  838    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  53.62 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  50.72 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  53.13 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  44.82 
 
 		 398 aa  293  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  42.28 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  41.6 
 
 		 392 aa  269  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  43.33 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  41.18 
 
 		 405 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  41.01 
 
 		 396 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  40.43 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  39.68 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  41.37 
 
 		 393 aa  249  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  41.1 
 
 		 401 aa  248  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  40.84 
 
 		 401 aa  246  6e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  40.71 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  40.86 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  38.11 
 
 		 399 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  36.09 
 
 		 576 aa  232  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2939  amidase  36.97 
 
 		 411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  37.73 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  37.83 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  40.71 
 
 		 579 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  37.92 
 
 		 389 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.91 
 
 		 535 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  36.2 
 
 		 341 aa  194  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  33.78 
 
 		 546 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  37.33 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3155  amidase  38.8 
 
 		 364 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  30.89 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  32.61 
 
 		 427 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  33.16 
 
 		 449 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  30.03 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  30.34 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  30.33 
 
 		 463 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  30.79 
 
 		 456 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  30.21 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  28.84 
 
 		 449 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  30.81 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  29.3 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  30.16 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  30.59 
 
 		 450 aa  140  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  28.57 
 
 		 457 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.57 
 
 		 491 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  28.42 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  28.91 
 
 		 452 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  31.48 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  28.05 
 
 		 449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  31.15 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2100  putative Asp-tRNA Asn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  32.88 
 
 		 374 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1917  hypothetical protein  28.78 
 
 		 494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  31.83 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  31.09 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  29.92 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  29.87 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  27.57 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  30.35 
 
 		 462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  29.67 
 
 		 467 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3581  amidase  31.08 
 
 		 422 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854746  normal  0.0626995 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1824  Amidase  28.84 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  29.67 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  29.67 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  28.72 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  29.67 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  29.67 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  29.67 
 
 		 454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.43 
 
 		 498 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  29.06 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  28.68 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.19 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1013  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.94 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29966  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  31.53 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  27.18 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  28.19 
 
 		 486 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  29.18 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  28.72 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  28.42 
 
 		 453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  29.1 
 
 		 457 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  27.69 
 
 		 449 aa  126  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  26.91 
 
 		 446 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  30.51 
 
 		 599 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.43 
 
 		 486 aa  126  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  29.2 
 
 		 600 aa  126  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.73 
 
 		 475 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3028  amidase  30.33 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  30 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  31.83 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  29.1 
 
 		 463 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  26.08 
 
 		 408 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  44.44 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  38.66 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2164  Amidase  32.87 
 
 		 374 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  29.23 
 
 		 440 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.22 
 
 		 480 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  46.05 
 
 		 456 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.1 
 
 		 479 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.34 
 
 		 483 aa  122  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4054  amidase  30 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  30.89 
 
 		 611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  28.95 
 
 		 457 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>