More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1685 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  100 
 
 		 388 aa  793    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  33.7 
 
 		 391 aa  206  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  32.87 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  29.76 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  31.45 
 
 		 411 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  30.41 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  30.56 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  29.59 
 
 		 394 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  29.59 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  29.94 
 
 		 398 aa  153  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  28.96 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  28.92 
 
 		 546 aa  149  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  31.48 
 
 		 401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  30.03 
 
 		 576 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  29.47 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  31.22 
 
 		 401 aa  146  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  29.49 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  31.35 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  31.1 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  28.33 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  31.98 
 
 		 535 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  31.73 
 
 		 395 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  28.95 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  29.09 
 
 		 389 aa  135  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  29.82 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  29.34 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  29.02 
 
 		 456 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2939  amidase  27.64 
 
 		 411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  26.98 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  29.66 
 
 		 456 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  26.88 
 
 		 449 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  28.14 
 
 		 341 aa  126  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  28.35 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  28.49 
 
 		 457 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  28.65 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  28.76 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  30.56 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  30.23 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  29.38 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  28.87 
 
 		 447 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  26.79 
 
 		 457 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  27.54 
 
 		 449 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  29.34 
 
 		 579 aa  109  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  26.17 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  28.11 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  27.39 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  26.53 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3155  amidase  30.66 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  26.36 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  27.58 
 
 		 408 aa  106  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  27.57 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  26.34 
 
 		 448 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  26.41 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  27.2 
 
 		 453 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  29.02 
 
 		 427 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  25.84 
 
 		 467 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  25.84 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  25.84 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  25.84 
 
 		 454 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  25.84 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  25.84 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  25.85 
 
 		 467 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  26.74 
 
 		 449 aa  102  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  27.46 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4592  amidase  27.57 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317108  normal  0.0439274 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  27.64 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  26.58 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  27.23 
 
 		 450 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  26.22 
 
 		 449 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  25.4 
 
 		 471 aa  99.4  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  25.85 
 
 		 446 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  25.75 
 
 		 607 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  26.1 
 
 		 453 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  27.85 
 
 		 457 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0979  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.49 
 
 		 470 aa  98.2  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  27.64 
 
 		 451 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3581  amidase  32.02 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854746  normal  0.0626995 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  26.51 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  26.99 
 
 		 440 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6031  amidase  27.81 
 
 		 449 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  26.38 
 
 		 450 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  25.53 
 
 		 458 aa  96.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.47 
 
 		 475 aa  96.7  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  28.16 
 
 		 453 aa  96.3  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  25.8 
 
 		 446 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  27.92 
 
 		 457 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  25.27 
 
 		 464 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  30.53 
 
 		 462 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1513  amidase  26.47 
 
 		 448 aa  94.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  37.75 
 
 		 400 aa  94  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  26.3 
 
 		 460 aa  93.6  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  26.13 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4961  amidase  28.45 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439817  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1917  hypothetical protein  25.07 
 
 		 494 aa  92.4  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4441  amidase  28.16 
 
 		 446 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  27.51 
 
 		 606 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  25.19 
 
 		 454 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1592  amidase  35.03 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  25.53 
 
 		 596 aa  90.1  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  26.37 
 
 		 600 aa  90.5  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>