More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0385 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0385  amidase  100 
 
 		 394 aa  788    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  80.61 
 
 		 393 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  60.93 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  48.84 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  49.73 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  45.18 
 
 		 395 aa  306  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  47.07 
 
 		 399 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  44.11 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  44.11 
 
 		 401 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  43.23 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  40.98 
 
 		 405 aa  269  8e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  41.46 
 
 		 391 aa  267  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  42.52 
 
 		 400 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  40 
 
 		 386 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  41.3 
 
 		 378 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  44.26 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  40.36 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  39.69 
 
 		 411 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  39.3 
 
 		 398 aa  222  8e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  41.22 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  37.95 
 
 		 576 aa  216  4e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  41.27 
 
 		 546 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  37.27 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  40.9 
 
 		 535 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  40.47 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  39.63 
 
 		 579 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  37.83 
 
 		 408 aa  182  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3155  amidase  42.09 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  30.2 
 
 		 388 aa  170  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2939  amidase  31.1 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  34.78 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  35.63 
 
 		 467 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  33.51 
 
 		 449 aa  152  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  34.61 
 
 		 467 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  34.62 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  34.62 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  34.62 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  34.32 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  34.62 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  34.62 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  38.69 
 
 		 379 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  34.38 
 
 		 467 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  31.59 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  33.06 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  31.94 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  36.31 
 
 		 369 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  34.49 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  32.63 
 
 		 413 aa  129  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1917  hypothetical protein  27.6 
 
 		 494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  33.16 
 
 		 453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.95 
 
 		 475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3977  amidase  32.66 
 
 		 425 aa  127  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  32.64 
 
 		 462 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.67 
 
 		 479 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6031  amidase  34.55 
 
 		 449 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  30.04 
 
 		 511 aa  126  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  48.07 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  31.47 
 
 		 457 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  30.23 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.94 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  31.78 
 
 		 449 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  31.35 
 
 		 449 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  30.57 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  37.36 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2100  putative Asp-tRNA Asn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.42 
 
 		 374 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  31.62 
 
 		 458 aa  123  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3581  amidase  29.54 
 
 		 422 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854746  normal  0.0626995 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  32.9 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  30.21 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  29.98 
 
 		 455 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  32.53 
 
 		 456 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.36 
 
 		 491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.68 
 
 		 481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  46.07 
 
 		 440 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  32.19 
 
 		 454 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  44.44 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.09 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  32.63 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  33.77 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  33.17 
 
 		 441 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1013  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.08 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29966  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  30.47 
 
 		 443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3059  amidase  31.76 
 
 		 473 aa  117  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477089  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  33.42 
 
 		 448 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl162  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.56 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  32.8 
 
 		 457 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  47.59 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  31.38 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  33.33 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2503  amidase  52.29 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3585  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.72 
 
 		 488 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  31.38 
 
 		 452 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  31.59 
 
 		 450 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  29.95 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  47.56 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.65 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0822  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.61 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.578935  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  31.76 
 
 		 601 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  32.14 
 
 		 625 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2164  Amidase  33.24 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>