More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1052 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1052  amidase  100 
 
 		 369 aa  725    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  59.29 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2100  putative Asp-tRNA Asn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  55.89 
 
 		 374 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5348  amidase  57.14 
 
 		 374 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.634434  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2164  Amidase  53.97 
 
 		 374 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3518  amidase  56.87 
 
 		 374 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0590183 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5086  amidase  56.63 
 
 		 374 aa  325  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.752662 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3908  amidase  55.22 
 
 		 374 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3612  amidase  54.67 
 
 		 374 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2503  amidase  54.67 
 
 		 374 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  54.1 
 
 		 377 aa  312  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  50 
 
 		 408 aa  309  4e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0320  pyrazinamidase/nicotinamidase  54.85 
 
 		 375 aa  298  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0746  amidase  51.1 
 
 		 382 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  42.2 
 
 		 416 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  37.75 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.51 
 
 		 475 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  34.86 
 
 		 449 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  32.45 
 
 		 470 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  35.41 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  34.68 
 
 		 405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  35.25 
 
 		 456 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  38.06 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  36.8 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  38.48 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1592  amidase  35.47 
 
 		 401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.49 
 
 		 475 aa  152  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  36.7 
 
 		 395 aa  152  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  33.5 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  32.71 
 
 		 464 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  35.45 
 
 		 450 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  36.05 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  36.16 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.5 
 
 		 426 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  33.87 
 
 		 449 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  32.17 
 
 		 391 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.75 
 
 		 485 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  32.89 
 
 		 470 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4393  amidase  35.85 
 
 		 450 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  33.62 
 
 		 341 aa  145  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1541  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.42 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.859243  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0772  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.76 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.630554  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.9 
 
 		 491 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  34.75 
 
 		 467 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  31.61 
 
 		 423 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.01 
 
 		 494 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  31.87 
 
 		 388 aa  142  7e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  33.88 
 
 		 378 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.68 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  35.48 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.85 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  32.43 
 
 		 457 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0835  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.22 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.417948  normal  0.79256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.41 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.37 
 
 		 479 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  35.71 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  37.3 
 
 		 454 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1297  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.83 
 
 		 433 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  32.88 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  32.17 
 
 		 413 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.63 
 
 		 486 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  33.79 
 
 		 449 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  36.14 
 
 		 393 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0184  amidase  35 
 
 		 480 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  35.31 
 
 		 395 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  34.54 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  32.72 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.92 
 
 		 483 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0638  amidase  37.14 
 
 		 401 aa  138  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.921571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  33.33 
 
 		 443 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  29.06 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  36.29 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  32.8 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  35.58 
 
 		 473 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0208  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.9 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.382536  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  32.52 
 
 		 461 aa  136  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  32.63 
 
 		 534 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  35.68 
 
 		 463 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2843  Amidase  30.45 
 
 		 503 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.942957  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  32.43 
 
 		 449 aa  135  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2208  amidase  30.47 
 
 		 511 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  32.35 
 
 		 511 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  35.03 
 
 		 476 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  35.81 
 
 		 468 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1933  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.73 
 
 		 474 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.129092  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  30.51 
 
 		 455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0857  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.99 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  35.5 
 
 		 458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  37.21 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1013  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.94 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29966  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.41 
 
 		 491 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0822  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.44 
 
 		 431 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.578935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.66 
 
 		 479 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  32.86 
 
 		 392 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  30.94 
 
 		 405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.09 
 
 		 488 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  33.86 
 
 		 599 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  36.39 
 
 		 470 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0756  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.24 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1769  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.96 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>