More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0862 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  100 
 
 		 391 aa  792    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  54.16 
 
 		 405 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  51.88 
 
 		 411 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  44.59 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  42.74 
 
 		 400 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  40.16 
 
 		 398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  42.51 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  41.89 
 
 		 405 aa  253  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  42.59 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  41.4 
 
 		 393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  43.75 
 
 		 399 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  42.94 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  41.35 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  41.73 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  42.93 
 
 		 401 aa  234  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  42.67 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2939  amidase  36.68 
 
 		 411 aa  226  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  39.58 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  40.59 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  39.73 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  38.85 
 
 		 389 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  40.49 
 
 		 378 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  36.6 
 
 		 576 aa  208  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  40.81 
 
 		 535 aa  199  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  38.17 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3155  amidase  41.13 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  33.15 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  37.77 
 
 		 546 aa  189  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  40.63 
 
 		 579 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  34.68 
 
 		 341 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  34.93 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  34.92 
 
 		 456 aa  143  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  30.38 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  31.34 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  31.17 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3581  amidase  31.44 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854746  normal  0.0626995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  29.43 
 
 		 463 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  33.5 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  31.93 
 
 		 449 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  30.19 
 
 		 423 aa  132  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  31.2 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  32.83 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  31.71 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  43.01 
 
 		 455 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  48.41 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  28.69 
 
 		 388 aa  129  9.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  28.61 
 
 		 454 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1824  Amidase  29.6 
 
 		 398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  42.02 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  45.68 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl162  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.3 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  30.13 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  29.82 
 
 		 449 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  44.91 
 
 		 601 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  42.49 
 
 		 453 aa  123  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  28.72 
 
 		 449 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  32.54 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  45.81 
 
 		 611 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  31.17 
 
 		 435 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  29.66 
 
 		 450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2100  putative Asp-tRNA Asn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  32.99 
 
 		 374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  42.42 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  47.74 
 
 		 451 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  28.11 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0746  amidase  33.06 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  44.52 
 
 		 607 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  39.33 
 
 		 456 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  28.47 
 
 		 446 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  32.61 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  43.02 
 
 		 625 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  44.17 
 
 		 603 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  29.85 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  45.52 
 
 		 600 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.67 
 
 		 475 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  45.16 
 
 		 611 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  30.3 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  47.56 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  34.35 
 
 		 607 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2164  Amidase  31.72 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  40.94 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  29.85 
 
 		 446 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  29.92 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  27.91 
 
 		 452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  27.55 
 
 		 511 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  41.36 
 
 		 464 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0710  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  40 
 
 		 485 aa  113  6e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  42.77 
 
 		 447 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  28.28 
 
 		 467 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  44.14 
 
 		 614 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  44.83 
 
 		 599 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  31.08 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  31.08 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  31.25 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  31.08 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  31.08 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  31.08 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0638  amidase  30.54 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.921571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.33 
 
 		 485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  41.86 
 
 		 596 aa  111  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  34.27 
 
 		 469 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>