More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2939 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2939  amidase  100 
 
 		 411 aa  851    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  45.69 
 
 		 398 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  37.77 
 
 		 391 aa  240  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  37.77 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  36.27 
 
 		 411 aa  209  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  32.12 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  31.55 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  32.55 
 
 		 392 aa  193  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  35.56 
 
 		 423 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  32.64 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  35.75 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  33.33 
 
 		 389 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  32.23 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  31.44 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  33.6 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  31.95 
 
 		 535 aa  162  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  30.13 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  31.11 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  31.02 
 
 		 546 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  31.11 
 
 		 401 aa  160  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  29.72 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  30.38 
 
 		 576 aa  152  7e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  31.37 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  31.1 
 
 		 394 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  29.44 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  31.72 
 
 		 378 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  28.84 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  30.77 
 
 		 341 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  30.39 
 
 		 579 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3581  amidase  28.37 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854746  normal  0.0626995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3155  amidase  28.8 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  28.2 
 
 		 440 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  27.56 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  27.06 
 
 		 457 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  29.82 
 
 		 465 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  31.53 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  26.44 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  27.5 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  26.32 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  29.78 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  26.57 
 
 		 436 aa  99.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1824  Amidase  24.35 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  25.88 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6031  amidase  27.99 
 
 		 449 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  28.1 
 
 		 457 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  28.42 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  26.18 
 
 		 446 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  23.96 
 
 		 449 aa  96.7  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  24.27 
 
 		 449 aa  96.3  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  27.43 
 
 		 457 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  25.76 
 
 		 447 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  26.18 
 
 		 446 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  28.49 
 
 		 450 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  25.55 
 
 		 451 aa  94.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  24.14 
 
 		 467 aa  92.8  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  26.49 
 
 		 448 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  24.74 
 
 		 449 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  27.39 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  27.59 
 
 		 447 aa  91.3  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  24.29 
 
 		 470 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  25.19 
 
 		 470 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  27.11 
 
 		 379 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  26.77 
 
 		 457 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  26.96 
 
 		 462 aa  90.5  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  24.62 
 
 		 454 aa  90.1  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  27.15 
 
 		 369 aa  90.1  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  26.78 
 
 		 464 aa  90.1  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  25.4 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  32.94 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  27.04 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  28.9 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  27.88 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  23.61 
 
 		 463 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  25.91 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  25.39 
 
 		 453 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  27.92 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  26.55 
 
 		 395 aa  87.4  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  33.96 
 
 		 456 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  25.23 
 
 		 447 aa  86.7  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  24.08 
 
 		 388 aa  86.7  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  25.27 
 
 		 458 aa  86.7  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  26.1 
 
 		 437 aa  86.7  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  25.93 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  24.31 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  25.66 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  25 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  25.45 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  23.44 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  25.45 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  34.1 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1654  amidase  39.13 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  23.86 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  25 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  26.61 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  33.7 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0220  amidohydrolase, AtzE family  38.22 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1162  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.04 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.894545  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3243  amidase  24.09 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0756  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.04 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  24.02 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>