More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1980 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  100 
 
 		 453 aa  880    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  60.28 
 
 		 457 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  57.11 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  58.92 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  60.29 
 
 		 413 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  59.2 
 
 		 448 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  59.2 
 
 		 448 aa  435  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  56.7 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  52.88 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  50 
 
 		 456 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  50.61 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  52.36 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  52.54 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  50.37 
 
 		 447 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  50.86 
 
 		 463 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  53.71 
 
 		 450 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  52.26 
 
 		 449 aa  365  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  47.77 
 
 		 449 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  49.61 
 
 		 449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  50.46 
 
 		 440 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  52.33 
 
 		 449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  50.69 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  48.83 
 
 		 450 aa  340  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  52.57 
 
 		 453 aa  335  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  52.54 
 
 		 447 aa  333  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  51.44 
 
 		 448 aa  329  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  51.04 
 
 		 452 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  52.2 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  52.54 
 
 		 458 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  50 
 
 		 462 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  51.78 
 
 		 458 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  51.78 
 
 		 458 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  51.38 
 
 		 476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  51.27 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  52.27 
 
 		 616 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  50.9 
 
 		 616 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  50.9 
 
 		 458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  50.9 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  50.9 
 
 		 616 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  50.9 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  50.9 
 
 		 458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  52.97 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  50.34 
 
 		 459 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  51.52 
 
 		 458 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  52.19 
 
 		 458 aa  295  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  51.52 
 
 		 458 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  44.6 
 
 		 456 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  46.58 
 
 		 457 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  44.78 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  51.15 
 
 		 481 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  41.94 
 
 		 459 aa  273  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  43.17 
 
 		 452 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  44.78 
 
 		 437 aa  259  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  48.85 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  46.77 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  40.18 
 
 		 453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  41.35 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  39.64 
 
 		 423 aa  231  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  40.28 
 
 		 442 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  45.94 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  38.6 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  42.75 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  40.65 
 
 		 446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  40.95 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  39.33 
 
 		 443 aa  206  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  39.53 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  39.11 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  46.98 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  42.01 
 
 		 465 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  42.4 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  40.46 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  35.96 
 
 		 432 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  36.14 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  34.23 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  40.21 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  35.42 
 
 		 467 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  33.87 
 
 		 447 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  38.7 
 
 		 460 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.55 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  35.28 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.48 
 
 		 461 aa  169  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0061  amidase  40.06 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222867  hitchhiker  0.0000105372 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  37.83 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  42.81 
 
 		 416 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.65 
 
 		 480 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1112  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.43 
 
 		 491 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.881874  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  32.45 
 
 		 457 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  35.88 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  35.68 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  29.04 
 
 		 470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  29.04 
 
 		 470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  35.19 
 
 		 601 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4364  amidase  33.18 
 
 		 471 aa  151  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000480403  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  36.32 
 
 		 454 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0989  amidase  33.49 
 
 		 470 aa  150  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  34.45 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  33.51 
 
 		 600 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  30.53 
 
 		 464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3243  amidase  34.22 
 
 		 474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  34.44 
 
 		 599 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>