More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5792 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  902    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  87.72 
 
 
456 aa  807    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  61.73 
 
 
459 aa  556  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  60.27 
 
 
453 aa  501  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  45.06 
 
 
442 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  45.89 
 
 
457 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  42.29 
 
 
456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  44.09 
 
 
449 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  44.5 
 
 
449 aa  276  5e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  44.44 
 
 
457 aa  276  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  45.14 
 
 
449 aa  276  7e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  43.57 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  41.94 
 
 
463 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  43.34 
 
 
449 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  41.56 
 
 
449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  45.43 
 
 
450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  41.02 
 
 
447 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  42.25 
 
 
450 aa  266  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  47.16 
 
 
457 aa  266  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  43.01 
 
 
450 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  44.81 
 
 
453 aa  260  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  41.86 
 
 
451 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  41.35 
 
 
440 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2093  hypothetical protein  44.78 
 
 
477 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0598821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  44.76 
 
 
453 aa  257  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  43.25 
 
 
413 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  38.48 
 
 
440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  43.65 
 
 
440 aa  252  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  39.25 
 
 
447 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  43.73 
 
 
457 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  41.78 
 
 
447 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  44.65 
 
 
448 aa  249  8e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  44.71 
 
 
458 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  45.59 
 
 
458 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  44.84 
 
 
458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  44.84 
 
 
458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  44.76 
 
 
476 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  44.95 
 
 
458 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  40.53 
 
 
469 aa  239  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  40.09 
 
 
437 aa  237  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  44.02 
 
 
427 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  43.52 
 
 
452 aa  236  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  38.51 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2027  Amidase  44.53 
 
 
475 aa  233  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  44.13 
 
 
458 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  44.13 
 
 
616 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  44.13 
 
 
458 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  44.13 
 
 
616 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  44.13 
 
 
616 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  39.56 
 
 
451 aa  232  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  44.13 
 
 
472 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  44.13 
 
 
472 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  44.19 
 
 
453 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  42.38 
 
 
441 aa  231  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  44.84 
 
 
458 aa  230  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  44.58 
 
 
458 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  43.75 
 
 
459 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  39.76 
 
 
441 aa  226  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  40.18 
 
 
462 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  37.11 
 
 
452 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  43.36 
 
 
481 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  42.56 
 
 
448 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  37.23 
 
 
407 aa  212  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  37.64 
 
 
443 aa  209  9e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  42.42 
 
 
448 aa  209  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  36.38 
 
 
441 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  36.61 
 
 
436 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  36.01 
 
 
423 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  44.74 
 
 
435 aa  206  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  38.72 
 
 
446 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  38.76 
 
 
446 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  43.9 
 
 
427 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0061  amidase  36.49 
 
 
443 aa  193  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222867  hitchhiker  0.0000105372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  37.11 
 
 
457 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0327  amidase  38.96 
 
 
422 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  38.29 
 
 
435 aa  183  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  32.54 
 
 
470 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  36.5 
 
 
443 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  33.64 
 
 
473 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  32.97 
 
 
463 aa  176  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  37.73 
 
 
458 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  35.17 
 
 
460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  30.6 
 
 
470 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  35.42 
 
 
461 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  37.37 
 
 
468 aa  166  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4364  amidase  35.31 
 
 
471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000480403  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  43.58 
 
 
464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.1 
 
 
480 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36.19 
 
 
463 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  33.04 
 
 
601 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  32.53 
 
 
549 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  36.48 
 
 
463 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8074  Amidase  34.43 
 
 
496 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3559  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.53 
 
 
498 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  31.77 
 
 
466 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1318  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.92 
 
 
502 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  32.31 
 
 
599 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  30.82 
 
 
475 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  33.88 
 
 
457 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.51 
 
 
499 aa  150  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>