More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0746 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0746  amidase  100 
 
 		 382 aa  746    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  54.27 
 
 		 379 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  51.09 
 
 		 408 aa  324  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2100  putative Asp-tRNA Asn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  50.14 
 
 		 374 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  51.1 
 
 		 369 aa  308  8e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2164  Amidase  50.96 
 
 		 374 aa  308  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5348  amidase  54.02 
 
 		 374 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.634434  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  50.94 
 
 		 377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3518  amidase  53.57 
 
 		 374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0590183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2503  amidase  51.52 
 
 		 374 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3908  amidase  51.52 
 
 		 374 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3612  amidase  51.25 
 
 		 374 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5086  amidase  51.81 
 
 		 374 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.752662 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0320  pyrazinamidase/nicotinamidase  52.37 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  42.81 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  35.52 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1297  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.36 
 
 		 433 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  35.59 
 
 		 400 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  35.99 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.41 
 
 		 480 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  36.78 
 
 		 447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  34.7 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  36.39 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  35.26 
 
 		 456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  38.36 
 
 		 449 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0772  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.96 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.630554  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  34.1 
 
 		 486 aa  162  6e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  37.8 
 
 		 458 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  37.3 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  33.5 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.1 
 
 		 486 aa  161  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0857  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.06 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0835  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.27 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.417948  normal  0.79256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  35.25 
 
 		 470 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  35.64 
 
 		 443 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1013  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.64 
 
 		 431 aa  159  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29966  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.09 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  36.89 
 
 		 463 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  36.84 
 
 		 427 aa  156  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.25 
 
 		 491 aa  156  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  36.51 
 
 		 457 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.14 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  34.9 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  31.36 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.85 
 
 		 483 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.35 
 
 		 485 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.91 
 
 		 486 aa  153  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.43 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  31.77 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  36.81 
 
 		 454 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  37.85 
 
 		 461 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  36.75 
 
 		 468 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  34.23 
 
 		 440 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  36.47 
 
 		 449 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.21 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  34.03 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  35.67 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  34.96 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.27 
 
 		 485 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  37.29 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  32.63 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  33.6 
 
 		 449 aa  150  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  37.29 
 
 		 399 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  36.05 
 
 		 448 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  34.38 
 
 		 446 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7145  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  36.53 
 
 		 470 aa  149  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  35.17 
 
 		 449 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  30.93 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.42 
 
 		 484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.11 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  34.85 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  37.53 
 
 		 471 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  36.2 
 
 		 458 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13411  amidase amiD (acylamidase)  32.55 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.21 
 
 		 479 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1141  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.66 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  33.85 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0928  amidase  34.94 
 
 		 466 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  32.81 
 
 		 450 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.65 
 
 		 481 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4393  amidase  35.66 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1769  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.77 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  34.67 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  33.68 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  33.49 
 
 		 511 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3550  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.1 
 
 		 432 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2843  Amidase  32.03 
 
 		 503 aa  143  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.942957  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  35.45 
 
 		 452 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.6 
 
 		 479 aa  143  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  34.98 
 
 		 450 aa  143  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1115  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.04 
 
 		 485 aa  143  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00160205  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  35.6 
 
 		 473 aa  142  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.76 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  37.54 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  36.31 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0638  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.74 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  35.54 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  36.39 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  37.91 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>