More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_17500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  100 
 
 
441 aa  865    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3977  amidase  43.55 
 
 
425 aa  277  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3474  indole acetimide hydrolase  42.59 
 
 
484 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.027239 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  42.44 
 
 
467 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  42.14 
 
 
467 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  42.68 
 
 
467 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  42.68 
 
 
467 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  42.68 
 
 
467 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  42.44 
 
 
454 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5709  indole acetimide hydrolase  42.55 
 
 
484 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  42.44 
 
 
467 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  42.44 
 
 
467 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  36.39 
 
 
455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1011  indole acetimide hydrolase  42.79 
 
 
484 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0836853 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8287  indole acetimide hydrolase  34.89 
 
 
462 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1337  indole acetimide hydrolase  38.84 
 
 
510 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000844127 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7043  indole acetimide hydrolase  39.23 
 
 
500 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.445138 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3059  amidase  39.9 
 
 
473 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477089  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  36.07 
 
 
446 aa  196  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3739  Amidase  34.15 
 
 
446 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3235  amidase  35.17 
 
 
488 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0114439  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.18 
 
 
483 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.94 
 
 
475 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  32.7 
 
 
466 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1537  amidase  34.32 
 
 
446 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.108403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0731  amidase  37.6 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.0567025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  33.58 
 
 
461 aa  173  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.62 
 
 
475 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.93 
 
 
485 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  30.26 
 
 
470 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  35.39 
 
 
511 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  35.63 
 
 
599 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  35.38 
 
 
447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  33.49 
 
 
456 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  34.49 
 
 
454 aa  167  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.43 
 
 
485 aa  166  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2208  amidase  31.76 
 
 
511 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.57 
 
 
481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.43 
 
 
470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  38.94 
 
 
461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.75 
 
 
479 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  36.82 
 
 
476 aa  162  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.03 
 
 
495 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2421  amidase  31.98 
 
 
511 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.9 
 
 
483 aa  162  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.95 
 
 
426 aa  161  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.8 
 
 
489 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.89 
 
 
486 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4320  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  38.23 
 
 
492 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2169  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.03 
 
 
489 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.403361  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.72 
 
 
479 aa  160  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0300  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.99 
 
 
489 aa  159  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  32.03 
 
 
472 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4188  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  37.2 
 
 
492 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.834018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.58 
 
 
480 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.15 
 
 
479 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1318  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.67 
 
 
516 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4342  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  38 
 
 
492 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.44 
 
 
485 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.6 
 
 
499 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2281  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.97 
 
 
501 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1020  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.1 
 
 
487 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00154188  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1112  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.17 
 
 
491 aa  156  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.881874  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  31.96 
 
 
477 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4338  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.51 
 
 
490 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.05 
 
 
485 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.47 
 
 
491 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.7 
 
 
498 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2838  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.89 
 
 
501 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.68 
 
 
494 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  32.19 
 
 
599 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  30.96 
 
 
607 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.22 
 
 
491 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1297  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.18 
 
 
433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1824  Amidase  29.4 
 
 
398 aa  153  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  31.49 
 
 
432 aa  153  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1461  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.49 
 
 
519 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2360  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.59 
 
 
487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.100992  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1917  hypothetical protein  27.13 
 
 
494 aa  153  7e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.55 
 
 
482 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0835  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.18 
 
 
434 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.417948  normal  0.79256 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.22 
 
 
491 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  33.66 
 
 
601 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4434  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  32.16 
 
 
486 aa  151  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.689377  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  33.58 
 
 
440 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1085  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.51 
 
 
518 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00466527  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.25 
 
 
488 aa  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0434  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.52 
 
 
475 aa  150  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0208  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.38 
 
 
453 aa  150  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.382536  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0068  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.22 
 
 
474 aa  150  6e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000049622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  34.84 
 
 
463 aa  150  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  33.92 
 
 
597 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0346  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.44 
 
 
482 aa  149  7e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0113738  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.19 
 
 
487 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0332  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.22 
 
 
483 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124108  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3585  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.57 
 
 
488 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768958  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0085  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.79 
 
 
496 aa  149  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0075  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.01 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.281052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3559  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.33 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  33.17 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>