More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1537 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1537  amidase  100 
 
 		 446 aa  912    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.108403 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3739  Amidase  58.43 
 
 		 446 aa  502  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  54.67 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  35.73 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1337  indole acetimide hydrolase  35.26 
 
 		 510 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000844127 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3474  indole acetimide hydrolase  36.27 
 
 		 484 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.027239 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8287  indole acetimide hydrolase  32.11 
 
 		 462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5709  indole acetimide hydrolase  34.3 
 
 		 484 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7043  indole acetimide hydrolase  33.69 
 
 		 500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445138 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3059  amidase  34.27 
 
 		 473 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477089  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  34.57 
 
 		 467 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3235  amidase  34.78 
 
 		 488 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0114439  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  34.07 
 
 		 467 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  34.07 
 
 		 467 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  34.07 
 
 		 454 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  34.07 
 
 		 467 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  34.07 
 
 		 467 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  34.07 
 
 		 467 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  33.83 
 
 		 467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  30.99 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1011  indole acetimide hydrolase  34.32 
 
 		 484 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0836853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.07 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  30.47 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.11 
 
 		 485 aa  162  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  31.61 
 
 		 447 aa  156  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  32.22 
 
 		 400 aa  156  9e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3977  amidase  31.91 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58180  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.16 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.82 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  33.92 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5097  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.96 
 
 		 484 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.26 
 
 		 484 aa  153  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1701  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.33 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  33.33 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  28.82 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.93 
 
 		 483 aa  149  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  33.16 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  31.13 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  29.09 
 
 		 481 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0731  amidase  34.91 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.0567025 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.14 
 
 		 475 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  29.66 
 
 		 423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1700  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.59 
 
 		 483 aa  146  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.56 
 
 		 479 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  32.04 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0322  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.65 
 
 		 497 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.39 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl162  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.61 
 
 		 482 aa  144  3e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  28.35 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  31.2 
 
 		 599 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  31.07 
 
 		 456 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.34 
 
 		 489 aa  143  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0638  amidase  31.86 
 
 		 401 aa  143  6e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.921571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  37.45 
 
 		 600 aa  143  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1933  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.19 
 
 		 474 aa  143  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.129092  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3835  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.61 
 
 		 489 aa  143  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  0.677458 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.67 
 
 		 486 aa  143  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1592  amidase  32.36 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1739  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.61 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  40.65 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.52 
 
 		 426 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.12 
 
 		 483 aa  141  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  41.26 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0085  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.21 
 
 		 496 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  31.83 
 
 		 437 aa  140  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0177  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.78 
 
 		 471 aa  140  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.979626  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  36.48 
 
 		 491 aa  139  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  28.54 
 
 		 456 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2843  Amidase  28.4 
 
 		 503 aa  139  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.942957  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  30 
 
 		 601 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1650  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.29 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000758087  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.51 
 
 		 495 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  31.12 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2636  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.06 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0836  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.66 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0318775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  28.96 
 
 		 607 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  36.02 
 
 		 599 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0518  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.29 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.436865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0827  Amidase  34.44 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0223449  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  31.89 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  30.92 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  37.7 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  31.3 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0622  amidase  32.86 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  28.33 
 
 		 600 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  32.38 
 
 		 463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0368  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.27 
 
 		 479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  31.97 
 
 		 471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  29.68 
 
 		 509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.23 
 
 		 485 aa  137  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  32.6 
 
 		 440 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0638  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.39 
 
 		 494 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  33.25 
 
 		 416 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2065  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.22 
 
 		 485 aa  136  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.700676 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1541  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  28.33 
 
 		 486 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.859243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  27.22 
 
 		 491 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0258  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.42 
 
 		 485 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1917  hypothetical protein  26.15 
 
 		 494 aa  134  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0234  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.1 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.808735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>