More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8287 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011982  Avi_8287  indole acetimide hydrolase  100 
 
 
462 aa  945    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  36.42 
 
 
455 aa  300  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7043  indole acetimide hydrolase  34.62 
 
 
500 aa  269  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.445138 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3059  amidase  36.11 
 
 
473 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477089  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3474  indole acetimide hydrolase  36.7 
 
 
484 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.027239 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5709  indole acetimide hydrolase  38.77 
 
 
484 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1011  indole acetimide hydrolase  36.11 
 
 
484 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0836853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1337  indole acetimide hydrolase  34.33 
 
 
510 aa  237  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000844127 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  32.03 
 
 
466 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  34.36 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.89 
 
 
441 aa  210  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3739  Amidase  33.26 
 
 
446 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  33.7 
 
 
454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  33.7 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  33.7 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  33.85 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  33.85 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  33.7 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  33.7 
 
 
467 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  34.29 
 
 
467 aa  201  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3235  amidase  29.8 
 
 
488 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0114439  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1537  amidase  32.11 
 
 
446 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.108403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  30.43 
 
 
461 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0731  amidase  32.2 
 
 
382 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.0567025 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  30.11 
 
 
470 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.26 
 
 
491 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3977  amidase  31.99 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.12 
 
 
485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.14 
 
 
495 aa  163  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  29.36 
 
 
470 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  30.86 
 
 
476 aa  160  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.81 
 
 
498 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.33 
 
 
475 aa  159  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.92 
 
 
485 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  33.67 
 
 
447 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  30.72 
 
 
454 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3176  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  29.12 
 
 
500 aa  157  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0085  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.83 
 
 
496 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.27 
 
 
499 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.43 
 
 
480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.79 
 
 
486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7145  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  28.13 
 
 
470 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  32.02 
 
 
447 aa  153  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.39 
 
 
491 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0220  amidase  29.2 
 
 
471 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855119  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  30.68 
 
 
432 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1701  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.72 
 
 
483 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  28.96 
 
 
463 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0231  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.61 
 
 
500 aa  150  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.747986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0237  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.61 
 
 
500 aa  150  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.780008 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.2 
 
 
483 aa  149  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.8 
 
 
486 aa  149  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.72 
 
 
484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.89 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  29.13 
 
 
463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0322  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.6 
 
 
497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.54 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.1 
 
 
486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1700  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.13 
 
 
483 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  28.42 
 
 
471 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2636  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.48 
 
 
483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.4 
 
 
494 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0506  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.8 
 
 
497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0104138 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02330  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.63 
 
 
477 aa  147  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.313614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4165  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.72 
 
 
483 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.72 
 
 
489 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4474  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.11 
 
 
483 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.57 
 
 
485 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  29.93 
 
 
464 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.72 
 
 
489 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0301  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.78 
 
 
485 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  32.55 
 
 
457 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.63 
 
 
481 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0289  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.57 
 
 
485 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4953  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.57 
 
 
485 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.25 
 
 
488 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0353  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.57 
 
 
485 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0367  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.57 
 
 
485 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2205  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30 
 
 
499 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0394  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.8 
 
 
485 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0350  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.8 
 
 
485 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1112  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.68 
 
 
491 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.881874  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0306  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.8 
 
 
485 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  29.14 
 
 
509 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0321  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.8 
 
 
485 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2111  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.67 
 
 
490 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.14975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1770  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.67 
 
 
490 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0827327  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  29.89 
 
 
461 aa  143  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0167  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.59 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  31.5 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.19 
 
 
486 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2838  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.46 
 
 
501 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.18 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2375  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.45 
 
 
482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000388033  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4284  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.9 
 
 
483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1547  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.44 
 
 
472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460524  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1935  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.68 
 
 
486 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186595  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1003  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.15 
 
 
484 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0298  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.6 
 
 
485 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1706  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  27.81 
 
 
491 aa  141  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.327066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>