More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2503 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  100 
 
 		 600 aa  1210    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  65.03 
 
 		 604 aa  723    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1418  allophanate hydrolase  68.39 
 
 		 609 aa  764    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  91.67 
 
 		 600 aa  1092    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  73.67 
 
 		 601 aa  866    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  53.46 
 
 		 616 aa  558  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  49.32 
 
 		 614 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  49.33 
 
 		 600 aa  512  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  50.56 
 
 		 597 aa  508  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  51.12 
 
 		 601 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  52.44 
 
 		 599 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  49.39 
 
 		 607 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  50.81 
 
 		 596 aa  496  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  46.83 
 
 		 598 aa  495  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  51.3 
 
 		 599 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  51.15 
 
 		 596 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  49.5 
 
 		 618 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  48.1 
 
 		 633 aa  482  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  49.03 
 
 		 601 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  46.7 
 
 		 601 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  52.39 
 
 		 606 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  45.98 
 
 		 1822 aa  475  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  50.37 
 
 		 628 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  53.99 
 
 		 601 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  48.09 
 
 		 631 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  48.53 
 
 		 611 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  46.35 
 
 		 598 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  44.37 
 
 		 600 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  49.83 
 
 		 599 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  48.19 
 
 		 611 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  46.2 
 
 		 601 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  49.35 
 
 		 603 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  47.9 
 
 		 621 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  47.63 
 
 		 607 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  49.75 
 
 		 621 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  49.53 
 
 		 597 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  51.04 
 
 		 600 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  50.73 
 
 		 609 aa  452  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  48.21 
 
 		 624 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  47.25 
 
 		 625 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  50 
 
 		 576 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  49.27 
 
 		 569 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  46.45 
 
 		 601 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  46.15 
 
 		 609 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  44.82 
 
 		 590 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  43.22 
 
 		 604 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  43.71 
 
 		 604 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  46.41 
 
 		 589 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  46.22 
 
 		 596 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  51.03 
 
 		 588 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  47.95 
 
 		 623 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  47.78 
 
 		 623 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  46.45 
 
 		 565 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  48.61 
 
 		 471 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  40.86 
 
 		 620 aa  348  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  37.92 
 
 		 569 aa  329  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  43.5 
 
 		 553 aa  322  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3670  amidase  42.99 
 
 		 627 aa  316  7e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  41.9 
 
 		 578 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  41.9 
 
 		 578 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  41.9 
 
 		 578 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5227  allophanate hydrolase  45.8 
 
 		 484 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  44.36 
 
 		 572 aa  306  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1595  allophanate hydrolase  44.49 
 
 		 554 aa  301  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0675  amidase  45.31 
 
 		 523 aa  299  9e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.496846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  42.45 
 
 		 603 aa  298  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1385  putative urea amidolyase  43.78 
 
 		 502 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209103  normal  0.0685044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  40.64 
 
 		 540 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6163  amidase  44.71 
 
 		 456 aa  291  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1484  amidase  43.98 
 
 		 460 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  41.77 
 
 		 595 aa  281  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0417  amidase  41.75 
 
 		 437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0350631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2764  amidase  44.09 
 
 		 467 aa  260  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2808  amidase  44.09 
 
 		 467 aa  260  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3052  amidase  42.82 
 
 		 467 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242622  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1891  Urea carboxylase  47.84 
 
 		 248 aa  195  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1114  Urea carboxylase  47.84 
 
 		 248 aa  195  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1917  allophanate hydrolase  43.19 
 
 		 186 aa  156  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.691164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1453  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.32 
 
 		 477 aa  150  5e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.67645  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.74 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.23 
 
 		 479 aa  148  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.59 
 
 		 485 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.12 
 
 		 426 aa  147  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.95 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.9 
 
 		 475 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.09 
 
 		 483 aa  143  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0085  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.81 
 
 		 496 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  31.28 
 
 		 470 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6767  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  36.23 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  35.14 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  32.41 
 
 		 457 aa  140  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1749  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.5 
 
 		 485 aa  139  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.47 
 
 		 475 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  32.83 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  31.67 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  32.22 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  33.69 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  31.66 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  31.03 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  30.29 
 
 		 470 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>