More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0832 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  69.49 
 
 		 569 aa  723    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  100 
 
 		 576 aa  1147    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  54.15 
 
 		 614 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  52.41 
 
 		 600 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  52.78 
 
 		 604 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  51.18 
 
 		 601 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  51.27 
 
 		 628 aa  501  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  52.09 
 
 		 599 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  51.37 
 
 		 599 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  50.81 
 
 		 597 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  51.06 
 
 		 596 aa  489  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  52.73 
 
 		 601 aa  488  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  52.45 
 
 		 597 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  47.78 
 
 		 598 aa  477  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  51.36 
 
 		 601 aa  475  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  51.3 
 
 		 600 aa  472  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  50.36 
 
 		 611 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  50.54 
 
 		 611 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  49.09 
 
 		 609 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  49 
 
 		 601 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  49.82 
 
 		 621 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  50.37 
 
 		 601 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  49.19 
 
 		 607 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  49.46 
 
 		 603 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  47.98 
 
 		 604 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  51.27 
 
 		 606 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  48 
 
 		 601 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  45.17 
 
 		 598 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  51.05 
 
 		 599 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  47.84 
 
 		 596 aa  458  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  50.18 
 
 		 625 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  51.07 
 
 		 609 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1418  allophanate hydrolase  50.09 
 
 		 609 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  46.1 
 
 		 607 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  49.38 
 
 		 631 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  50.18 
 
 		 600 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  50 
 
 		 600 aa  445  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  47.73 
 
 		 604 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  46.94 
 
 		 590 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  50.45 
 
 		 621 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  47.6 
 
 		 618 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  50.09 
 
 		 633 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  46.82 
 
 		 616 aa  437  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  45.65 
 
 		 624 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  50.82 
 
 		 601 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  48.19 
 
 		 589 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  52.82 
 
 		 588 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  43.98 
 
 		 600 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  48.78 
 
 		 623 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  48.14 
 
 		 623 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  42.62 
 
 		 1822 aa  399  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  47.5 
 
 		 596 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  44.55 
 
 		 620 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  44.76 
 
 		 565 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  51.53 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  43.82 
 
 		 540 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  43.09 
 
 		 553 aa  338  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  42.93 
 
 		 578 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  42.93 
 
 		 578 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  42.93 
 
 		 578 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  41.94 
 
 		 569 aa  317  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  44.82 
 
 		 572 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0675  amidase  47.72 
 
 		 523 aa  313  6.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.496846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  43.76 
 
 		 603 aa  311  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1595  allophanate hydrolase  43.2 
 
 		 554 aa  307  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1385  putative urea amidolyase  45.87 
 
 		 502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209103  normal  0.0685044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5227  allophanate hydrolase  47.26 
 
 		 484 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  42.75 
 
 		 595 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3670  amidase  41.8 
 
 		 627 aa  303  7.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6163  amidase  43.6 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3052  amidase  43.53 
 
 		 467 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242622  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1484  amidase  41.67 
 
 		 460 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2764  amidase  45.55 
 
 		 467 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2808  amidase  45.55 
 
 		 467 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294171 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0417  amidase  42.09 
 
 		 437 aa  237  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0350631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1891  Urea carboxylase  47.97 
 
 		 248 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1114  Urea carboxylase  47.97 
 
 		 248 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1917  allophanate hydrolase  41.38 
 
 		 186 aa  164  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.691164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.57 
 
 		 426 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.83 
 
 		 475 aa  144  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1302  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.72 
 
 		 491 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.584243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.06 
 
 		 475 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.16 
 
 		 487 aa  136  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  33.42 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.44 
 
 		 485 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.34 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  33.76 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  34.91 
 
 		 400 aa  135  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0085  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.61 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.626452  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.38 
 
 		 479 aa  134  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.43 
 
 		 491 aa  133  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.71 
 
 		 485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  32.53 
 
 		 449 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.99 
 
 		 483 aa  131  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1591  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.92 
 
 		 488 aa  132  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  30.45 
 
 		 470 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15821  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.18 
 
 		 486 aa  130  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  31.61 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1580  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.32 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.24 
 
 		 491 aa  128  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>