More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0675 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0675  amidase  100 
 
 		 523 aa  1005    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.496846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  49.39 
 
 		 471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  48.6 
 
 		 607 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  47.76 
 
 		 614 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  53.2 
 
 		 599 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  54.03 
 
 		 599 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  50.51 
 
 		 611 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  52.81 
 
 		 601 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  49.9 
 
 		 611 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  47.96 
 
 		 628 aa  385  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  47.41 
 
 		 607 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  50.1 
 
 		 603 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  48.01 
 
 		 625 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  52.48 
 
 		 597 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  43.78 
 
 		 597 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  47.98 
 
 		 601 aa  364  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  46.22 
 
 		 600 aa  363  6e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  50.4 
 
 		 599 aa  362  9e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  48.96 
 
 		 631 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  47.45 
 
 		 601 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1385  putative urea amidolyase  45.81 
 
 		 502 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209103  normal  0.0685044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  47.63 
 
 		 596 aa  355  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  47.51 
 
 		 596 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5227  allophanate hydrolase  46.62 
 
 		 484 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  46.15 
 
 		 601 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  48.04 
 
 		 623 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  48.25 
 
 		 623 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  47.05 
 
 		 601 aa  350  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  53.55 
 
 		 624 aa  350  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  51.76 
 
 		 596 aa  350  5e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  43.52 
 
 		 604 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  41.01 
 
 		 598 aa  344  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  47.12 
 
 		 600 aa  342  8e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  42.69 
 
 		 604 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  53.11 
 
 		 621 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  51.54 
 
 		 589 aa  330  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  45.49 
 
 		 620 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  43.48 
 
 		 590 aa  329  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  44.61 
 
 		 616 aa  329  7e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2764  amidase  47.56 
 
 		 467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2808  amidase  47.56 
 
 		 467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3052  amidase  45.26 
 
 		 467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242622  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  47.54 
 
 		 633 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  47.02 
 
 		 618 aa  326  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  45.67 
 
 		 598 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  43.79 
 
 		 604 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  43 
 
 		 609 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  53.37 
 
 		 609 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  38.17 
 
 		 600 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  43.39 
 
 		 601 aa  313  5.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  48.03 
 
 		 588 aa  312  9e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  50.96 
 
 		 569 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  51.33 
 
 		 621 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  44.39 
 
 		 606 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  48.2 
 
 		 576 aa  303  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1418  allophanate hydrolase  44.94 
 
 		 609 aa  296  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  45.31 
 
 		 600 aa  296  5e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6163  amidase  46.11 
 
 		 456 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  44.9 
 
 		 600 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  43.64 
 
 		 601 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1484  amidase  41.67 
 
 		 460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  45.83 
 
 		 565 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  42.74 
 
 		 1822 aa  274  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  46.79 
 
 		 569 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  44.15 
 
 		 578 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  44.15 
 
 		 578 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  44.15 
 
 		 578 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0417  amidase  35.03 
 
 		 437 aa  243  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0350631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  41.79 
 
 		 540 aa  229  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  48.31 
 
 		 572 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1595  allophanate hydrolase  45.54 
 
 		 554 aa  217  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  45.69 
 
 		 603 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  39.96 
 
 		 553 aa  216  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  44.76 
 
 		 595 aa  210  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3670  amidase  40.33 
 
 		 627 aa  199  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  33.5 
 
 		 447 aa  147  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.67 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1701  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.55 
 
 		 483 aa  143  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  31.5 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  31.91 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.94 
 
 		 475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.02 
 
 		 485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  34.36 
 
 		 468 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  33.4 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.22 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.81 
 
 		 483 aa  139  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0688  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.6 
 
 		 484 aa  139  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3436  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.99 
 
 		 506 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1700  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.48 
 
 		 483 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1318  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.33 
 
 		 516 aa  137  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  32.52 
 
 		 509 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  32.15 
 
 		 456 aa  136  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.57 
 
 		 489 aa  136  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  34.41 
 
 		 457 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1033  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.93 
 
 		 492 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1453  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.12 
 
 		 477 aa  136  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.67645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.79 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.57 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  35.48 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.2 
 
 		 485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>