More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3052 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2764  amidase  81.51 
 
 		 467 aa  713    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2808  amidase  81.51 
 
 		 467 aa  713    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3052  amidase  100 
 
 		 467 aa  943    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242622  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  60.58 
 
 		 620 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  45.61 
 
 		 601 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  44.98 
 
 		 599 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  45.21 
 
 		 471 aa  363  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  45.18 
 
 		 599 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  44.18 
 
 		 597 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  45.43 
 
 		 600 aa  342  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  45.14 
 
 		 611 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  42.26 
 
 		 607 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  44.55 
 
 		 628 aa  340  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1385  putative urea amidolyase  45.16 
 
 		 502 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209103  normal  0.0685044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5227  allophanate hydrolase  45.14 
 
 		 484 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  47.07 
 
 		 603 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  45.81 
 
 		 596 aa  335  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  45.65 
 
 		 631 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0675  amidase  45.65 
 
 		 523 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.496846 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  46.78 
 
 		 623 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  44.71 
 
 		 611 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  40.53 
 
 		 598 aa  330  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  46.56 
 
 		 623 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  45.41 
 
 		 616 aa  329  6e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  44.44 
 
 		 614 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  50 
 
 		 599 aa  323  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  45.7 
 
 		 601 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  43.14 
 
 		 601 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  43.02 
 
 		 607 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  43.04 
 
 		 597 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  46.32 
 
 		 596 aa  316  5e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  43.29 
 
 		 625 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6163  amidase  44.63 
 
 		 456 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649279 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  45.95 
 
 		 601 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  43.93 
 
 		 596 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  46.63 
 
 		 589 aa  303  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  48.39 
 
 		 600 aa  298  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  40.64 
 
 		 600 aa  293  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  43.57 
 
 		 604 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  43.3 
 
 		 633 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  43.42 
 
 		 590 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  42.72 
 
 		 609 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  43.81 
 
 		 601 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  43.64 
 
 		 604 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  42.15 
 
 		 618 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1484  amidase  43.25 
 
 		 460 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  43.66 
 
 		 604 aa  280  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  44.75 
 
 		 609 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  41.51 
 
 		 598 aa  277  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  47.31 
 
 		 621 aa  276  6e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  41.93 
 
 		 606 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  39.83 
 
 		 624 aa  276  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  42.23 
 
 		 601 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  43.61 
 
 		 576 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  46.28 
 
 		 601 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1418  allophanate hydrolase  42.79 
 
 		 609 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  37.42 
 
 		 1822 aa  266  8e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  44.66 
 
 		 621 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  43.16 
 
 		 588 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  41.1 
 
 		 600 aa  253  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  42.82 
 
 		 600 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  43.14 
 
 		 569 aa  246  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  43.61 
 
 		 565 aa  244  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  45.24 
 
 		 569 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0417  amidase  38.12 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0350631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  43.46 
 
 		 603 aa  224  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  38.48 
 
 		 540 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  39.33 
 
 		 578 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  39.33 
 
 		 578 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  39.33 
 
 		 578 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  39.66 
 
 		 553 aa  204  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1595  allophanate hydrolase  42.53 
 
 		 554 aa  204  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  41.12 
 
 		 595 aa  196  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  42.64 
 
 		 572 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3670  amidase  37.79 
 
 		 627 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  32.06 
 
 		 458 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.83 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  33.73 
 
 		 461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  30.27 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  33.41 
 
 		 456 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.91 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  38.05 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  29.09 
 
 		 456 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  38.72 
 
 		 464 aa  123  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.65 
 
 		 491 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1453  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.77 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.67645  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl162  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.49 
 
 		 482 aa  121  3e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0688  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.49 
 
 		 484 aa  121  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  33.09 
 
 		 447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.84 
 
 		 483 aa  120  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.52 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  28.68 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  30.67 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  31.7 
 
 		 388 aa  119  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  28.54 
 
 		 466 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  31.09 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.37 
 
 		 479 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0258  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.15 
 
 		 485 aa  117  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  28.26 
 
 		 459 aa  116  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  27.6 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>