More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0944 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  60.03 
 
 
614 aa  687    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  100 
 
 
628 aa  1279    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  58.21 
 
 
600 aa  657    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  59.37 
 
 
596 aa  621  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  58.18 
 
 
600 aa  601  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  51.55 
 
 
598 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  51.01 
 
 
604 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  54.28 
 
 
596 aa  560  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  50.82 
 
 
598 aa  560  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  57.1 
 
 
609 aa  558  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  53.1 
 
 
601 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  49.6 
 
 
609 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  50.5 
 
 
604 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  50.5 
 
 
590 aa  555  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  50.73 
 
 
607 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  53.45 
 
 
599 aa  545  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  53.7 
 
 
623 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  50.9 
 
 
599 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  53.04 
 
 
623 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  47.7 
 
 
597 aa  529  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  48.76 
 
 
601 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  53.2 
 
 
601 aa  524  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  50.73 
 
 
599 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  51.28 
 
 
607 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  49.13 
 
 
611 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  49.59 
 
 
604 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  51.28 
 
 
603 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  48.96 
 
 
611 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  48.43 
 
 
601 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  49.6 
 
 
633 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  50 
 
 
618 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  48.26 
 
 
601 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  50 
 
 
589 aa  502  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  48.69 
 
 
631 aa  498  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  50.08 
 
 
624 aa  498  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  51.09 
 
 
576 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  47.15 
 
 
597 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1418  allophanate hydrolase  49.91 
 
 
609 aa  492  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  47.83 
 
 
606 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  47.63 
 
 
616 aa  481  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  51.01 
 
 
600 aa  481  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  49.36 
 
 
625 aa  478  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  47.47 
 
 
601 aa  478  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  49.83 
 
 
569 aa  478  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  50.37 
 
 
600 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  50.72 
 
 
621 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  43.42 
 
 
600 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  48.18 
 
 
601 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  48.18 
 
 
621 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1385  putative urea amidolyase  55.56 
 
 
502 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209103  normal  0.0685044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  45.8 
 
 
596 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5227  allophanate hydrolase  57.66 
 
 
484 aa  445  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  50.16 
 
 
588 aa  432  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  44.09 
 
 
1822 aa  428  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  48.48 
 
 
471 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  42.28 
 
 
620 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0675  amidase  47.96 
 
 
523 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.496846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  43.46 
 
 
565 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  39.74 
 
 
569 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2764  amidase  46.9 
 
 
467 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2808  amidase  46.9 
 
 
467 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.294171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3052  amidase  46.21 
 
 
467 aa  346  8.999999999999999e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242622  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  41.59 
 
 
578 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  41.59 
 
 
578 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  41.59 
 
 
578 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  42.7 
 
 
553 aa  322  9.000000000000001e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  41.8 
 
 
603 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  43.6 
 
 
572 aa  320  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  42.47 
 
 
595 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1595  allophanate hydrolase  42.4 
 
 
554 aa  306  5.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  37.72 
 
 
540 aa  306  9.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1484  amidase  44.47 
 
 
460 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6163  amidase  44.22 
 
 
456 aa  300  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.649279 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3670  amidase  39.31 
 
 
627 aa  280  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0417  amidase  43.33 
 
 
437 aa  276  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0350631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1114  Urea carboxylase  46.89 
 
 
248 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636598  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1891  Urea carboxylase  46.89 
 
 
248 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.22 
 
 
483 aa  179  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.25 
 
 
475 aa  167  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.12 
 
 
487 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.77 
 
 
485 aa  163  7e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.65 
 
 
485 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.66 
 
 
475 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.21 
 
 
483 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1453  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.41 
 
 
477 aa  162  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.67645  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.88 
 
 
479 aa  161  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1917  allophanate hydrolase  41.52 
 
 
186 aa  159  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.691164  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.66 
 
 
486 aa  159  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  30.41 
 
 
486 aa  159  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.58 
 
 
470 aa  157  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.83 
 
 
486 aa  156  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.83 
 
 
485 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.09 
 
 
485 aa  155  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  34.06 
 
 
461 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.53 
 
 
486 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11900  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.91 
 
 
496 aa  154  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.38 
 
 
491 aa  153  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1580  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.08 
 
 
488 aa  154  7e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.61 
 
 
426 aa  153  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.17 
 
 
483 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>