86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1917 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1917  allophanate hydrolase  100 
 
 		 186 aa  378  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.691164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  49.77 
 
 		 604 aa  198  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1418  allophanate hydrolase  45.75 
 
 		 609 aa  172  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  44.13 
 
 		 601 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  45.37 
 
 		 621 aa  169  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  45.97 
 
 		 569 aa  168  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  47.74 
 
 		 616 aa  168  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  42.99 
 
 		 631 aa  167  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  48.57 
 
 		 621 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  41.38 
 
 		 576 aa  163  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  43.81 
 
 		 606 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  43.66 
 
 		 601 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  43.19 
 
 		 600 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  41.52 
 
 		 628 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  41.12 
 
 		 599 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  43.93 
 
 		 599 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  43.98 
 
 		 600 aa  156  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  43.19 
 
 		 600 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  42.06 
 
 		 599 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  39.72 
 
 		 597 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  42.4 
 
 		 614 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  45.93 
 
 		 601 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  43.98 
 
 		 601 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  41.67 
 
 		 607 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  43.9 
 
 		 624 aa  148  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  41.63 
 
 		 601 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  41.12 
 
 		 597 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  41.52 
 
 		 611 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  40.89 
 
 		 611 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  39.38 
 
 		 1822 aa  144  9e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  42.45 
 
 		 596 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  40 
 
 		 598 aa  142  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  39.61 
 
 		 590 aa  141  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  38.32 
 
 		 604 aa  140  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  36.92 
 
 		 604 aa  140  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  39.82 
 
 		 601 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  40.55 
 
 		 618 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  38.71 
 
 		 600 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  40.43 
 
 		 633 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  40.18 
 
 		 603 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  40.65 
 
 		 598 aa  137  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  40 
 
 		 609 aa  137  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  48.11 
 
 		 565 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  40.69 
 
 		 596 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1114  Urea carboxylase  40.28 
 
 		 248 aa  134  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1891  Urea carboxylase  40.28 
 
 		 248 aa  134  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  38.39 
 
 		 609 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  39.81 
 
 		 601 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  40.28 
 
 		 625 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  37.16 
 
 		 600 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  40.27 
 
 		 623 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  41.1 
 
 		 607 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  39.73 
 
 		 623 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  40.54 
 
 		 588 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  41.18 
 
 		 589 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  42.86 
 
 		 595 aa  121  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  38.89 
 
 		 596 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  37.75 
 
 		 540 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1595  allophanate hydrolase  40.96 
 
 		 554 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  40 
 
 		 553 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  35.55 
 
 		 578 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  35.55 
 
 		 578 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  35.55 
 
 		 578 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3670  amidase  36.36 
 
 		 627 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  35.64 
 
 		 569 aa  104  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  39.7 
 
 		 572 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  39.78 
 
 		 603 aa  100  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1221  putative amidase protein  52.58 
 
 		 149 aa  98.2  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  34.8 
 
 		 620 aa  82  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  49.3 
 
 		 471 aa  72  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5227  allophanate hydrolase  52.24 
 
 		 484 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1385  putative urea amidolyase  52.31 
 
 		 502 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209103  normal  0.0685044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03660  hypothetical protein  36.84 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4198  hypothetical protein  36.84 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226422 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03711  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0675  amidase  48.44 
 
 		 523 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.496846 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6163  amidase  41.27 
 
 		 456 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1484  amidase  44.83 
 
 		 460 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2756  AIG2 family protein  36.63 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3052  amidase  36.36 
 
 		 467 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242622  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2808  amidase  40 
 
 		 467 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2764  amidase  40 
 
 		 467 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25110  hypothetical protein  32.99 
 
 		 456 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0418  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  45 
 
 		 499 aa  44.7  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118613 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1453  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  40 
 
 		 477 aa  43.5  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.67645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2360  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  38.33 
 
 		 487 aa  41.2  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.100992  normal  0.201159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>