More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1367 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  88 
 
 		 618 aa  1086    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  100 
 
 		 633 aa  1268    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  56.93 
 
 		 606 aa  631  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  57.91 
 
 		 601 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  52.02 
 
 		 607 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  52.15 
 
 		 611 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  52.16 
 
 		 611 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  49.52 
 
 		 614 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  48.08 
 
 		 597 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  51.42 
 
 		 601 aa  525  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  49.76 
 
 		 628 aa  519  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  50.24 
 
 		 600 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  51.94 
 
 		 603 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1418  allophanate hydrolase  51.42 
 
 		 609 aa  510  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  51.29 
 
 		 625 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  48.31 
 
 		 599 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  49.76 
 
 		 600 aa  498  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  46.65 
 
 		 607 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  47.37 
 
 		 601 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  49.27 
 
 		 601 aa  498  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  48.95 
 
 		 599 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  47.15 
 
 		 601 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  49.44 
 
 		 604 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  51.52 
 
 		 600 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  50 
 
 		 589 aa  486  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  49.03 
 
 		 621 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  50 
 
 		 596 aa  484  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  46.54 
 
 		 596 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  49.64 
 
 		 616 aa  475  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  44.35 
 
 		 598 aa  472  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  46.83 
 
 		 601 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  46.53 
 
 		 597 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  49.43 
 
 		 601 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  53.68 
 
 		 621 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  49.03 
 
 		 631 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  48.11 
 
 		 624 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  49.04 
 
 		 600 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  48.29 
 
 		 599 aa  458  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  49.44 
 
 		 609 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  48.89 
 
 		 623 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  42.67 
 
 		 600 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  42.99 
 
 		 598 aa  452  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  48.41 
 
 		 623 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  50.18 
 
 		 576 aa  439  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  45.96 
 
 		 1822 aa  436  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  44.64 
 
 		 604 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  43.37 
 
 		 609 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  43.3 
 
 		 604 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  45.71 
 
 		 596 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  41.87 
 
 		 590 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  49.26 
 
 		 569 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  47.9 
 
 		 588 aa  398  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  45.71 
 
 		 565 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  43.95 
 
 		 578 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  43.95 
 
 		 578 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  43.95 
 
 		 578 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  40.46 
 
 		 620 aa  360  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  46.49 
 
 		 471 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  41.46 
 
 		 569 aa  352  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5227  allophanate hydrolase  49.05 
 
 		 484 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3670  amidase  42.18 
 
 		 627 aa  349  7e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1385  putative urea amidolyase  47.86 
 
 		 502 aa  346  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209103  normal  0.0685044 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1595  allophanate hydrolase  44.46 
 
 		 554 aa  343  5.999999999999999e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  45.19 
 
 		 572 aa  343  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  44.15 
 
 		 553 aa  342  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0675  amidase  47.54 
 
 		 523 aa  340  5e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.496846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  43.56 
 
 		 595 aa  334  3e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  42.01 
 
 		 603 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  39 
 
 		 540 aa  313  9e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1484  amidase  46.45 
 
 		 460 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2764  amidase  44.59 
 
 		 467 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2808  amidase  44.59 
 
 		 467 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3052  amidase  43.3 
 
 		 467 aa  299  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242622  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6163  amidase  45.65 
 
 		 456 aa  290  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649279 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0417  amidase  41.02 
 
 		 437 aa  269  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0350631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1114  Urea carboxylase  47.54 
 
 		 248 aa  194  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1891  Urea carboxylase  47.54 
 
 		 248 aa  194  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  33.26 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.28 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  30.43 
 
 		 509 aa  154  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.23 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  33.75 
 
 		 449 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.37 
 
 		 426 aa  150  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  30.27 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  33.16 
 
 		 449 aa  149  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.14 
 
 		 475 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  32.74 
 
 		 464 aa  148  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 		 485 aa  148  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  32.38 
 
 		 449 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0346  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.91 
 
 		 482 aa  147  7.0000000000000006e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0113738  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1453  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.36 
 
 		 477 aa  146  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.67645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.71 
 
 		 483 aa  146  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  30.3 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.9 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  31.22 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.08 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  31.57 
 
 		 458 aa  143  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6031  amidase  34.8 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  32.81 
 
 		 461 aa  143  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0688  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.55 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>