More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0711 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  100 
 
 		 595 aa  1127    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  56.89 
 
 		 578 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  56.89 
 
 		 578 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  56.89 
 
 		 578 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  55.03 
 
 		 603 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  55.99 
 
 		 572 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  55.71 
 
 		 565 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  53.33 
 
 		 540 aa  438  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  52.77 
 
 		 553 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1595  allophanate hydrolase  54.38 
 
 		 554 aa  415  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3670  amidase  48.38 
 
 		 627 aa  412  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  43.53 
 
 		 601 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  46.25 
 
 		 600 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  43.93 
 
 		 599 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  45.7 
 
 		 599 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  42.29 
 
 		 597 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  45.39 
 
 		 623 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  45.79 
 
 		 623 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  44.59 
 
 		 633 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  44.61 
 
 		 618 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  40.54 
 
 		 598 aa  364  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  46.84 
 
 		 596 aa  363  4e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  44.27 
 
 		 614 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  45.98 
 
 		 596 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  45.7 
 
 		 596 aa  356  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  41.06 
 
 		 607 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  43.54 
 
 		 590 aa  355  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  41.87 
 
 		 604 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  46.68 
 
 		 621 aa  352  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  44.67 
 
 		 601 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  43.68 
 
 		 601 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  43.24 
 
 		 601 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  42.19 
 
 		 607 aa  349  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  43.41 
 
 		 631 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  43.69 
 
 		 604 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  48.36 
 
 		 599 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  42.07 
 
 		 1822 aa  343  7e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  45.27 
 
 		 609 aa  342  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  44.18 
 
 		 603 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  42.96 
 
 		 606 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  45.17 
 
 		 611 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  43.28 
 
 		 597 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  43.23 
 
 		 624 aa  340  5e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  43.45 
 
 		 609 aa  340  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  44.18 
 
 		 601 aa  340  5e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  44.46 
 
 		 600 aa  339  7e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  44.57 
 
 		 611 aa  336  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  41.76 
 
 		 628 aa  335  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  43.4 
 
 		 604 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  43.28 
 
 		 616 aa  330  4e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  41.54 
 
 		 601 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  40.23 
 
 		 601 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  43.36 
 
 		 621 aa  327  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  45.64 
 
 		 588 aa  327  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  44.15 
 
 		 569 aa  323  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  42.75 
 
 		 576 aa  323  5e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  43.44 
 
 		 625 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  36.55 
 
 		 600 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  41.41 
 
 		 589 aa  310  6.999999999999999e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  37.74 
 
 		 598 aa  304  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  40.95 
 
 		 600 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1418  allophanate hydrolase  40.63 
 
 		 609 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  42.08 
 
 		 600 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  40.51 
 
 		 569 aa  293  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  39.72 
 
 		 620 aa  269  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5227  allophanate hydrolase  45.12 
 
 		 484 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1385  putative urea amidolyase  43.45 
 
 		 502 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209103  normal  0.0685044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  39.01 
 
 		 471 aa  239  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0675  amidase  42.86 
 
 		 523 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.496846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2764  amidase  44.1 
 
 		 467 aa  233  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2808  amidase  44.1 
 
 		 467 aa  233  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3052  amidase  41.43 
 
 		 467 aa  226  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242622  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1484  amidase  38.22 
 
 		 460 aa  220  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6163  amidase  38.41 
 
 		 456 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649279 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0417  amidase  35.92 
 
 		 437 aa  177  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0350631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1891  Urea carboxylase  47.01 
 
 		 248 aa  150  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1114  Urea carboxylase  47.01 
 
 		 248 aa  150  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  35.52 
 
 		 457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  32.39 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  35.25 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  36.8 
 
 		 453 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  33.16 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  32.26 
 
 		 443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  33.67 
 
 		 458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  28.57 
 
 		 405 aa  133  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  33.25 
 
 		 449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  32.56 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.48 
 
 		 483 aa  130  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  30.15 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  34.17 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.75 
 
 		 485 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  34.17 
 
 		 469 aa  127  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  33.07 
 
 		 413 aa  127  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1917  allophanate hydrolase  42.65 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.691164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  29.85 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  33.33 
 
 		 446 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.58 
 
 		 467 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  33.51 
 
 		 446 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  35.2 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  34.57 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>