More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0905 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  100 
 
 		 565 aa  1066    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  66.9 
 
 		 572 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  50.85 
 
 		 601 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  49.57 
 
 		 599 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  52.36 
 
 		 578 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  49.4 
 
 		 599 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  52.36 
 
 		 578 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  52.36 
 
 		 578 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  48.39 
 
 		 604 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1595  allophanate hydrolase  53.75 
 
 		 554 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  48.46 
 
 		 631 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  47.59 
 
 		 601 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  55.73 
 
 		 595 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  51.37 
 
 		 553 aa  415  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  46.23 
 
 		 614 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  44.16 
 
 		 597 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  47.47 
 
 		 601 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  45.88 
 
 		 607 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3670  amidase  51 
 
 		 627 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  49.73 
 
 		 596 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  48.21 
 
 		 601 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  48.13 
 
 		 601 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  52.53 
 
 		 588 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  45.63 
 
 		 616 aa  396  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  48.36 
 
 		 597 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  49.34 
 
 		 600 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  45.11 
 
 		 606 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  45.5 
 
 		 618 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  46.8 
 
 		 600 aa  395  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  48.2 
 
 		 603 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  51.9 
 
 		 599 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  43.26 
 
 		 600 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  46.67 
 
 		 623 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  45.68 
 
 		 633 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  47.35 
 
 		 623 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1418  allophanate hydrolase  45.66 
 
 		 609 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  48.35 
 
 		 609 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  47.64 
 
 		 596 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  44.65 
 
 		 601 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  48.1 
 
 		 600 aa  382  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  44.29 
 
 		 607 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  46 
 
 		 601 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  43.8 
 
 		 628 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  44.85 
 
 		 576 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  45.88 
 
 		 603 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  46.69 
 
 		 589 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  46.13 
 
 		 596 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  40.61 
 
 		 598 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  45.41 
 
 		 624 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  47.43 
 
 		 621 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  47.79 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  48.27 
 
 		 621 aa  365  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  44.92 
 
 		 611 aa  361  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  41.07 
 
 		 598 aa  360  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  44.58 
 
 		 611 aa  360  5e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  37.5 
 
 		 600 aa  359  7e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  44.28 
 
 		 590 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  47.11 
 
 		 569 aa  353  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  40.77 
 
 		 1822 aa  347  3e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  44.29 
 
 		 625 aa  345  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  42.99 
 
 		 604 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  42.51 
 
 		 604 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  42.88 
 
 		 609 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  43.28 
 
 		 620 aa  333  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  44.04 
 
 		 569 aa  325  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5227  allophanate hydrolase  48.51 
 
 		 484 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1385  putative urea amidolyase  50.12 
 
 		 502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209103  normal  0.0685044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0675  amidase  46.49 
 
 		 523 aa  302  9e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.496846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  45.28 
 
 		 471 aa  294  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3052  amidase  43.55 
 
 		 467 aa  264  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242622  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2764  amidase  44.63 
 
 		 467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2808  amidase  44.63 
 
 		 467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294171 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6163  amidase  40.98 
 
 		 456 aa  230  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1484  amidase  39.6 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0417  amidase  35.58 
 
 		 437 aa  214  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0350631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  38.73 
 
 		 457 aa  173  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  34.79 
 
 		 463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  40.71 
 
 		 450 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  35.42 
 
 		 449 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  36.01 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  35.29 
 
 		 449 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  37.18 
 
 		 448 aa  154  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  37.41 
 
 		 448 aa  154  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  34.38 
 
 		 449 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  33.26 
 
 		 464 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  33.94 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  36.13 
 
 		 453 aa  150  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  31.19 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  35.54 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  36.91 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  33.85 
 
 		 470 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  36.13 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  33.94 
 
 		 449 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  34.68 
 
 		 449 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  38.89 
 
 		 453 aa  146  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.91 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  35.64 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  33.59 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  35.97 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  28.22 
 
 		 455 aa  145  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>