More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0605 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  60.77 
 
 		 624 aa  650    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  100 
 
 		 589 aa  1167    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  49.58 
 
 		 614 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  50 
 
 		 628 aa  513  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  52.61 
 
 		 601 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  49 
 
 		 607 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  50.84 
 
 		 601 aa  505  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  53.35 
 
 		 599 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  52.53 
 
 		 599 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  52.43 
 
 		 596 aa  491  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  50.51 
 
 		 601 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  52.87 
 
 		 599 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  50.33 
 
 		 618 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  46.71 
 
 		 597 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  50.33 
 
 		 603 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  50.32 
 
 		 633 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  48.43 
 
 		 600 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  51.42 
 
 		 604 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  51.96 
 
 		 597 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  48.67 
 
 		 596 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  48.22 
 
 		 611 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  49.73 
 
 		 606 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1418  allophanate hydrolase  48.63 
 
 		 609 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  51.22 
 
 		 600 aa  461  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  52.36 
 
 		 621 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  47.97 
 
 		 611 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  50.09 
 
 		 607 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  49.01 
 
 		 604 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  49.1 
 
 		 590 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  49.57 
 
 		 601 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  48.83 
 
 		 601 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  49.09 
 
 		 631 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  48.85 
 
 		 616 aa  451  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  50.34 
 
 		 623 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  51.03 
 
 		 601 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  45.8 
 
 		 598 aa  443  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  50.93 
 
 		 623 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  47.33 
 
 		 604 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  49.29 
 
 		 600 aa  438  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  48.18 
 
 		 625 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  47.09 
 
 		 609 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  48.45 
 
 		 576 aa  430  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  48.04 
 
 		 600 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  48.67 
 
 		 601 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  46.6 
 
 		 598 aa  425  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  48.31 
 
 		 609 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  51.04 
 
 		 569 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  49.45 
 
 		 621 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  43.33 
 
 		 600 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  46.31 
 
 		 596 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  51.49 
 
 		 588 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  44.73 
 
 		 1822 aa  388  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  45.11 
 
 		 620 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  49.53 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  47.05 
 
 		 565 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  43.25 
 
 		 569 aa  369  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  44.42 
 
 		 578 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  44.42 
 
 		 578 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  44.42 
 
 		 578 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5227  allophanate hydrolase  49.56 
 
 		 484 aa  343  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0675  amidase  50.88 
 
 		 523 aa  339  7e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.496846 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1385  putative urea amidolyase  49.77 
 
 		 502 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209103  normal  0.0685044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  46.8 
 
 		 572 aa  327  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3670  amidase  43.88 
 
 		 627 aa  321  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2764  amidase  48.51 
 
 		 467 aa  319  7e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2808  amidase  48.51 
 
 		 467 aa  319  7e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294171 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  44.09 
 
 		 603 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3052  amidase  46.63 
 
 		 467 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242622  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1595  allophanate hydrolase  42.24 
 
 		 554 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  43.5 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1484  amidase  44.75 
 
 		 460 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  40.22 
 
 		 540 aa  296  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6163  amidase  45.43 
 
 		 456 aa  297  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  41.46 
 
 		 595 aa  290  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0417  amidase  42.31 
 
 		 437 aa  234  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0350631 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  34.13 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  34.13 
 
 		 467 aa  157  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  31.97 
 
 		 459 aa  156  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  34.06 
 
 		 467 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.15 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.32 
 
 		 483 aa  154  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.2 
 
 		 480 aa  153  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.53 
 
 		 491 aa  153  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  33.26 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  45.54 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  45.54 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  45.49 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  45.54 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  45.97 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  33.33 
 
 		 476 aa  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32 
 
 		 494 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  32.74 
 
 		 463 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1453  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.08 
 
 		 477 aa  150  7e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.67645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  33.41 
 
 		 461 aa  150  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  33.04 
 
 		 449 aa  150  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  33.26 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  32.59 
 
 		 458 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.14 
 
 		 483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.22 
 
 		 485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.3 
 
 		 487 aa  147  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>