More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4052 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  100 
 
 		 540 aa  1050    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  57.93 
 
 		 553 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  55.38 
 
 		 578 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  55.38 
 
 		 578 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3670  amidase  53.87 
 
 		 627 aa  465  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  55.38 
 
 		 578 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1595  allophanate hydrolase  55.02 
 
 		 554 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  53.33 
 
 		 595 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  49.82 
 
 		 603 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  42.03 
 
 		 597 aa  354  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  43.34 
 
 		 599 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  42.07 
 
 		 601 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  46.84 
 
 		 565 aa  343  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  41.5 
 
 		 599 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  42.5 
 
 		 576 aa  338  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  42.12 
 
 		 616 aa  335  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  42.38 
 
 		 631 aa  329  9e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  40.57 
 
 		 604 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  41.99 
 
 		 611 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  41.79 
 
 		 596 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  43.31 
 
 		 601 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  41.7 
 
 		 611 aa  319  9e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  47.92 
 
 		 572 aa  319  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  39.33 
 
 		 600 aa  317  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  40.49 
 
 		 614 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  41.8 
 
 		 597 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  42.56 
 
 		 601 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  41.62 
 
 		 621 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  42.39 
 
 		 609 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  41.73 
 
 		 596 aa  315  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  38.08 
 
 		 1822 aa  313  4.999999999999999e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  41.27 
 
 		 601 aa  312  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  40.42 
 
 		 590 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  41.96 
 
 		 623 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  42.03 
 
 		 601 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  42.42 
 
 		 569 aa  309  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  40.04 
 
 		 604 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  39.52 
 
 		 603 aa  306  6e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  39.82 
 
 		 607 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  44.5 
 
 		 599 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  42.23 
 
 		 623 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  39.89 
 
 		 596 aa  300  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  39.66 
 
 		 604 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  37.27 
 
 		 607 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  37.23 
 
 		 598 aa  297  4e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  40.11 
 
 		 618 aa  297  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  39.41 
 
 		 606 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  36.31 
 
 		 598 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  38.42 
 
 		 633 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  37.72 
 
 		 628 aa  294  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  40.79 
 
 		 621 aa  293  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  39.09 
 
 		 601 aa  293  7e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  39.96 
 
 		 625 aa  292  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  40.75 
 
 		 609 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  40.64 
 
 		 600 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1418  allophanate hydrolase  39.07 
 
 		 609 aa  282  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  34.65 
 
 		 600 aa  282  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  39.15 
 
 		 600 aa  281  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  43.16 
 
 		 588 aa  280  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  38.94 
 
 		 600 aa  280  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  40.22 
 
 		 589 aa  277  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  39.59 
 
 		 601 aa  273  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  39.07 
 
 		 624 aa  270  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5227  allophanate hydrolase  43.72 
 
 		 484 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  37.89 
 
 		 569 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1385  putative urea amidolyase  40.79 
 
 		 502 aa  242  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209103  normal  0.0685044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  38.06 
 
 		 620 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0675  amidase  41.79 
 
 		 523 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.496846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2764  amidase  39.71 
 
 		 467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2808  amidase  39.71 
 
 		 467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3052  amidase  38.48 
 
 		 467 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242622  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  38.29 
 
 		 471 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6163  amidase  37.56 
 
 		 456 aa  211  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1484  amidase  36.71 
 
 		 460 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0417  amidase  34.93 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0350631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  34.7 
 
 		 463 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  33.51 
 
 		 446 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  33.51 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  36.49 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1114  Urea carboxylase  41.05 
 
 		 248 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1891  Urea carboxylase  41.05 
 
 		 248 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25110  hypothetical protein  38.5 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  34.19 
 
 		 449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  34.92 
 
 		 457 aa  130  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  32.82 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  32.73 
 
 		 450 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  33.42 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  34.66 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  33.17 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  34.07 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  32.05 
 
 		 443 aa  117  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  29.79 
 
 		 464 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1917  allophanate hydrolase  37.75 
 
 		 186 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.691164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  34.39 
 
 		 457 aa  113  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  31.28 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  33.16 
 
 		 449 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  31.84 
 
 		 463 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  31.23 
 
 		 456 aa  108  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  32.46 
 
 		 457 aa  107  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  35.27 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>