More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3729 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  100 
 
 		 572 aa  1098    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  67.44 
 
 		 565 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  53.04 
 
 		 578 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  53.04 
 
 		 578 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  53.04 
 
 		 578 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  55.99 
 
 		 595 aa  458  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  44.99 
 
 		 601 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  45.98 
 
 		 614 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  45.76 
 
 		 599 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  44.86 
 
 		 599 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3670  amidase  48.68 
 
 		 627 aa  411  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  48.51 
 
 		 596 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  44.64 
 
 		 600 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  47.54 
 
 		 601 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1595  allophanate hydrolase  49.31 
 
 		 554 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  47.06 
 
 		 601 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  49.64 
 
 		 553 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  45.33 
 
 		 601 aa  399  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  45.3 
 
 		 631 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  42.71 
 
 		 607 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  45.74 
 
 		 618 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  45.03 
 
 		 604 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  48.21 
 
 		 603 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  46.77 
 
 		 596 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  41.77 
 
 		 597 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  44.93 
 
 		 633 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  48.64 
 
 		 540 aa  392  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  46.15 
 
 		 600 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  48 
 
 		 609 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  46.8 
 
 		 589 aa  385  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  44.58 
 
 		 606 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  43.72 
 
 		 616 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  45.29 
 
 		 601 aa  382  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  42.6 
 
 		 607 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  43.87 
 
 		 601 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  45.54 
 
 		 624 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  48.8 
 
 		 599 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  50.26 
 
 		 588 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  39.93 
 
 		 598 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  44.61 
 
 		 596 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  42.5 
 
 		 628 aa  369  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  40.73 
 
 		 1822 aa  366  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  44.5 
 
 		 597 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  45.32 
 
 		 623 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  44.74 
 
 		 611 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  42.73 
 
 		 590 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  44.39 
 
 		 611 aa  365  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  45.07 
 
 		 623 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  44.81 
 
 		 603 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  46.15 
 
 		 621 aa  363  6e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  40.07 
 
 		 598 aa  360  5e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  44.64 
 
 		 576 aa  359  8e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  42 
 
 		 604 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  42.22 
 
 		 601 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1418  allophanate hydrolase  43.53 
 
 		 609 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  44.36 
 
 		 600 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  41.25 
 
 		 604 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  42.26 
 
 		 609 aa  355  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  42.81 
 
 		 600 aa  350  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  37.52 
 
 		 600 aa  342  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  45.21 
 
 		 621 aa  342  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  45.93 
 
 		 569 aa  334  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  44.32 
 
 		 569 aa  332  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  41.69 
 
 		 625 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  40.46 
 
 		 620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5227  allophanate hydrolase  47.62 
 
 		 484 aa  289  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0675  amidase  43.98 
 
 		 523 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.496846 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1385  putative urea amidolyase  46.1 
 
 		 502 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209103  normal  0.0685044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  44.42 
 
 		 471 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6163  amidase  43.11 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2764  amidase  43.17 
 
 		 467 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2808  amidase  43.17 
 
 		 467 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1484  amidase  41.18 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3052  amidase  41.89 
 
 		 467 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242622  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0417  amidase  38.48 
 
 		 437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0350631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  34.46 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  35.91 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  35.77 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.65 
 
 		 483 aa  163  9e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  37.82 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  35.06 
 
 		 450 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  38.06 
 
 		 469 aa  161  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  35.25 
 
 		 449 aa  161  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  35.37 
 
 		 452 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  40.74 
 
 		 448 aa  160  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.59 
 
 		 485 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  40 
 
 		 448 aa  158  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  34.74 
 
 		 449 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  36.49 
 
 		 449 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  38.65 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  35.73 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  35.32 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  37.95 
 
 		 447 aa  152  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  38.11 
 
 		 453 aa  152  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.1 
 
 		 485 aa  151  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  34.23 
 
 		 511 aa  151  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  37.14 
 
 		 453 aa  150  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.71 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  34.85 
 
 		 476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.8 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>