More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1333 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1333  amidase  100 
 
 		 468 aa  915    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  51.17 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  40.04 
 
 		 491 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  40.75 
 
 		 491 aa  323  6e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  40.54 
 
 		 491 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  42.41 
 
 		 488 aa  320  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  40.54 
 
 		 491 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  40.54 
 
 		 491 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  41.88 
 
 		 491 aa  319  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  48.37 
 
 		 475 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  41.67 
 
 		 491 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  40.75 
 
 		 491 aa  315  9e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  39.71 
 
 		 491 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  39.71 
 
 		 491 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  44.81 
 
 		 540 aa  290  5.0000000000000004e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  44.56 
 
 		 526 aa  289  7e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  36.56 
 
 		 536 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  36.34 
 
 		 536 aa  267  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1739  amidase  35.62 
 
 		 536 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138161  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1957  amidase  35.41 
 
 		 536 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000744293 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1782  amidase  35.36 
 
 		 536 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1921  amidase  35.36 
 
 		 536 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.246226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3418  amidase  36.23 
 
 		 536 aa  262  8e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  42.2 
 
 		 536 aa  261  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1761  amidase  35.78 
 
 		 536 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2026  amidase  35.19 
 
 		 536 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00167874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  43.69 
 
 		 574 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2005  amidase  35.81 
 
 		 533 aa  256  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.512259  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  41.2 
 
 		 519 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  38.38 
 
 		 544 aa  251  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  40.72 
 
 		 540 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3057  amidase  43.17 
 
 		 513 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.567901  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2754  Amidase  43 
 
 		 533 aa  249  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.518277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3420  amidase  45.74 
 
 		 543 aa  244  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  39.74 
 
 		 519 aa  239  9e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2331  amidase  44.99 
 
 		 540 aa  229  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2061  amidase  44 
 
 		 528 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1454  amidase  43.86 
 
 		 528 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1369  amidase  44 
 
 		 528 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3236  amidase  43.65 
 
 		 528 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.595988  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3121  amidase  43.65 
 
 		 528 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2352  amidase  44 
 
 		 528 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1087  amidase  44 
 
 		 528 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05965  amidase  32.47 
 
 		 542 aa  223  4.9999999999999996e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316578  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3426  amidase  37.89 
 
 		 520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000155871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4304  amidase  39.57 
 
 		 505 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  36.95 
 
 		 499 aa  206  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  36.81 
 
 		 509 aa  203  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  36.97 
 
 		 526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  32.22 
 
 		 530 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  32.87 
 
 		 581 aa  189  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1019  amidase  35.28 
 
 		 610 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  35.27 
 
 		 566 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  35.79 
 
 		 534 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  36.04 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  33.8 
 
 		 506 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2838  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.63 
 
 		 501 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  40.2 
 
 		 491 aa  170  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  41.91 
 
 		 463 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  43.3 
 
 		 466 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.4 
 
 		 491 aa  169  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1364  amidase  35.14 
 
 		 527 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.085889  normal  0.210091 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.41 
 
 		 486 aa  167  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1458  Amidase  38.3 
 
 		 466 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.249504  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2226  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34 
 
 		 491 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0279752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0507  amidase  35.85 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371136 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  44.98 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3474  indole acetimide hydrolase  33.66 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.027239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2896  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  42.96 
 
 		 488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  34.71 
 
 		 559 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1318  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  43.33 
 
 		 502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2368  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  35.5 
 
 		 496 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.84 
 
 		 483 aa  163  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1112  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.81 
 
 		 491 aa  163  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.881874  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2332  amidase  34.65 
 
 		 542 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13411  amidase amiD (acylamidase)  42.46 
 
 		 475 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5709  indole acetimide hydrolase  33.14 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1318  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.93 
 
 		 516 aa  161  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  37.12 
 
 		 485 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1564  Amidase  34.88 
 
 		 527 aa  161  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0827  Amidase  44.87 
 
 		 470 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0223449  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  44.26 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1020  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.23 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00154188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5308  amidase  40 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2270  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.34 
 
 		 491 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4286  amidase  37.03 
 
 		 466 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508501  normal  0.0108693 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  42.67 
 
 		 463 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0945  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.47 
 
 		 491 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281317  normal  0.630797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  31.67 
 
 		 470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2636  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.42 
 
 		 483 aa  156  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.61 
 
 		 512 aa  156  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.11 
 
 		 479 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  39.25 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4623  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.43 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  32.49 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.31 
 
 		 488 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  47.7 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15821  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.51 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  34.75 
 
 		 476 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>