More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5120 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  100 
 
 		 519 aa  1053    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4304  amidase  45.87 
 
 		 505 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  48.1 
 
 		 540 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  44.87 
 
 		 536 aa  347  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  44.28 
 
 		 481 aa  342  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  43 
 
 		 540 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  42.19 
 
 		 488 aa  319  6e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  39.91 
 
 		 491 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  45.42 
 
 		 574 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  42.07 
 
 		 526 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  39.48 
 
 		 491 aa  307  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  38.63 
 
 		 491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  37.76 
 
 		 491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2061  amidase  43.82 
 
 		 528 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1369  amidase  43.82 
 
 		 528 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2352  amidase  43.82 
 
 		 528 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3121  amidase  43.82 
 
 		 528 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3236  amidase  43.82 
 
 		 528 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.595988  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1087  amidase  43.82 
 
 		 528 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  39.27 
 
 		 491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1454  amidase  43.98 
 
 		 528 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  39.27 
 
 		 491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  37.76 
 
 		 491 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  38.71 
 
 		 491 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  38.41 
 
 		 491 aa  300  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  42.8 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  37.37 
 
 		 491 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1739  amidase  38.46 
 
 		 536 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138161  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2331  amidase  41.88 
 
 		 540 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1957  amidase  38.24 
 
 		 536 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000744293 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1761  amidase  38.33 
 
 		 536 aa  281  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2026  amidase  38.02 
 
 		 536 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00167874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1782  amidase  38.24 
 
 		 536 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1921  amidase  38.24 
 
 		 536 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.246226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  38.16 
 
 		 536 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3420  amidase  41.24 
 
 		 543 aa  276  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3418  amidase  37.36 
 
 		 536 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  37.36 
 
 		 536 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2754  Amidase  41.08 
 
 		 533 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.518277 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2005  amidase  37.94 
 
 		 533 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.512259  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  37.17 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1019  amidase  38 
 
 		 610 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  38.94 
 
 		 519 aa  254  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  36.48 
 
 		 544 aa  253  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3057  amidase  39.54 
 
 		 513 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.567901  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1333  amidase  41.2 
 
 		 468 aa  242  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  35.85 
 
 		 499 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  35.22 
 
 		 530 aa  228  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  34.6 
 
 		 526 aa  227  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  35.37 
 
 		 509 aa  224  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3426  amidase  36.71 
 
 		 520 aa  223  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000155871  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05965  amidase  33.55 
 
 		 542 aa  207  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316578  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  36.25 
 
 		 559 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  44.58 
 
 		 1806 aa  190  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  38.83 
 
 		 1632 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06951  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  31.77 
 
 		 592 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  30.85 
 
 		 506 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1364  amidase  33.2 
 
 		 527 aa  179  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.085889  normal  0.210091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3176  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.29 
 
 		 500 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  33.26 
 
 		 461 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  32.54 
 
 		 566 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.59 
 
 		 491 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.61 
 
 		 495 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.22 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1564  Amidase  33.33 
 
 		 527 aa  167  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  33.97 
 
 		 473 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8074  Amidase  33.8 
 
 		 496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0085  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.7 
 
 		 496 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2896  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.01 
 
 		 488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1118  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.33 
 
 		 505 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00327681  hitchhiker  0.000372157 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.12 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2226  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.24 
 
 		 491 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0279752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.16 
 
 		 498 aa  160  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.32 
 
 		 491 aa  159  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.77 
 
 		 484 aa  159  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1714  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.72 
 
 		 504 aa  159  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.12 
 
 		 486 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  31.3 
 
 		 476 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.11 
 
 		 484 aa  158  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0231  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.49 
 
 		 500 aa  158  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.747986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0237  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.49 
 
 		 500 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.780008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.67 
 
 		 488 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4089  Amidase  33.2 
 
 		 497 aa  157  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.447444 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2827  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  32.25 
 
 		 499 aa  156  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.39 
 
 		 485 aa  156  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0163  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  41.5 
 
 		 499 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.74 
 
 		 485 aa  156  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  36.75 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2368  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  33.19 
 
 		 496 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.73 
 
 		 505 aa  155  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3559  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.64 
 
 		 498 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.79 
 
 		 483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  35.5 
 
 		 470 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1003  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.81 
 
 		 484 aa  154  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10590  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.65 
 
 		 503 aa  154  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.701412  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3928  amidase  33.19 
 
 		 491 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0519913  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1458  Amidase  34.05 
 
 		 466 aa  154  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.249504  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0049  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.99 
 
 		 499 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1307  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.7 
 
 		 525 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  32.82 
 
 		 468 aa  153  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>