More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2005 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2005  amidase  100 
 
 
533 aa  1084    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.512259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1782  amidase  91.71 
 
 
536 aa  986    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1957  amidase  91.71 
 
 
536 aa  986    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000744293 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1761  amidase  91.9 
 
 
536 aa  986    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1739  amidase  92.28 
 
 
536 aa  990    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1921  amidase  91.71 
 
 
536 aa  986    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.246226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2026  amidase  92.47 
 
 
536 aa  991    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00167874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  90.77 
 
 
536 aa  980    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  93.03 
 
 
536 aa  1005    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3418  amidase  91.15 
 
 
536 aa  990    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  42.71 
 
 
488 aa  350  4e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  41.32 
 
 
491 aa  349  8e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  42.47 
 
 
491 aa  347  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  41.32 
 
 
491 aa  346  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  40.5 
 
 
491 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  41.61 
 
 
491 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  41.61 
 
 
491 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  41.61 
 
 
491 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  40.91 
 
 
491 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  40.29 
 
 
491 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  40.08 
 
 
491 aa  332  9e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  39.75 
 
 
481 aa  330  5.0000000000000004e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  38.2 
 
 
475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  38.1 
 
 
526 aa  306  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05965  amidase  37.05 
 
 
542 aa  305  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316578  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  38.27 
 
 
540 aa  298  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  38.34 
 
 
540 aa  294  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  37.94 
 
 
519 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  36.32 
 
 
519 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  37.72 
 
 
574 aa  283  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  36.49 
 
 
536 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4304  amidase  36.44 
 
 
505 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2754  Amidase  35.86 
 
 
533 aa  256  6e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.518277 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1333  amidase  35.81 
 
 
468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  33.93 
 
 
526 aa  246  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1454  amidase  37.42 
 
 
528 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3236  amidase  37.42 
 
 
528 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.595988  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3121  amidase  37.42 
 
 
528 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2352  amidase  37.42 
 
 
528 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2061  amidase  37.42 
 
 
528 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1369  amidase  37.42 
 
 
528 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1087  amidase  37.42 
 
 
528 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  35.76 
 
 
530 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  35.15 
 
 
544 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3426  amidase  36.07 
 
 
520 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000155871  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2331  amidase  37.47 
 
 
540 aa  229  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3420  amidase  37.94 
 
 
543 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  32.94 
 
 
499 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  31.2 
 
 
509 aa  219  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1019  amidase  31.37 
 
 
610 aa  216  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46113  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3057  amidase  36.48 
 
 
513 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.567901  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  31.31 
 
 
581 aa  206  8e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  30.83 
 
 
559 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0762  Amidase  43.52 
 
 
374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  28.43 
 
 
506 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  28.74 
 
 
566 aa  176  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1364  amidase  28.82 
 
 
527 aa  170  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.085889  normal  0.210091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.84 
 
 
1806 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.41 
 
 
488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  35.84 
 
 
1632 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.9 
 
 
484 aa  161  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.06 
 
 
479 aa  161  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.14 
 
 
494 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2730  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.16 
 
 
485 aa  159  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0351101  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1564  Amidase  28.63 
 
 
527 aa  159  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.145247  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.22 
 
 
475 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06951  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  28.69 
 
 
592 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.05 
 
 
486 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.67 
 
 
491 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.34 
 
 
491 aa  157  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.1 
 
 
495 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02330  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.12 
 
 
477 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.313614  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.26 
 
 
483 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.18 
 
 
486 aa  152  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.9 
 
 
485 aa  151  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  27.36 
 
 
486 aa  151  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  27.52 
 
 
466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  29.88 
 
 
476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.08 
 
 
489 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.68 
 
 
485 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  28.69 
 
 
463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.53 
 
 
484 aa  147  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0322  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.49 
 
 
497 aa  147  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1453  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.03 
 
 
477 aa  147  5e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.67645  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1650  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.14 
 
 
483 aa  146  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000758087  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0518  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.14 
 
 
483 aa  146  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.436865  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.01 
 
 
486 aa  146  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0258  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.07 
 
 
485 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  27.99 
 
 
466 aa  146  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.3 
 
 
482 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.8 
 
 
486 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2636  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.04 
 
 
483 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13411  amidase amiD (acylamidase)  26.75 
 
 
475 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  30.71 
 
 
463 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.96 
 
 
485 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  29.38 
 
 
461 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.66 
 
 
498 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1221  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.01 
 
 
494 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.14 
 
 
482 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1541  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  30 
 
 
486 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.859243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>