More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0762 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0762  Amidase  100 
 
 
374 aa  749    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2026  amidase  42.91 
 
 
536 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00167874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  42.51 
 
 
536 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1739  amidase  42.11 
 
 
536 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3418  amidase  42.51 
 
 
536 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2005  amidase  43.46 
 
 
533 aa  186  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.512259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1782  amidase  42.51 
 
 
536 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1761  amidase  42.11 
 
 
536 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1921  amidase  42.51 
 
 
536 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.246226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  42.51 
 
 
536 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1957  amidase  41.7 
 
 
536 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000744293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  46.02 
 
 
481 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05965  amidase  42.23 
 
 
542 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  46.41 
 
 
491 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  44.63 
 
 
491 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  44.94 
 
 
491 aa  133  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  44.63 
 
 
491 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  45.51 
 
 
491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  45.51 
 
 
491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  44.94 
 
 
491 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  44.94 
 
 
491 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  44.94 
 
 
491 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  49.43 
 
 
530 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  42.25 
 
 
491 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  41.53 
 
 
488 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  42.53 
 
 
540 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  42.78 
 
 
526 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1333  amidase  43.33 
 
 
468 aa  119  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  39.22 
 
 
475 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  40.45 
 
 
526 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  39.6 
 
 
519 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  39.29 
 
 
519 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  37.31 
 
 
509 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  43.1 
 
 
499 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1019  amidase  40.54 
 
 
610 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46113  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  39.74 
 
 
559 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2754  Amidase  41.67 
 
 
533 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.518277 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  42.03 
 
 
544 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  44.57 
 
 
540 aa  99.4  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  37.09 
 
 
536 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3426  amidase  37.09 
 
 
520 aa  90.5  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000155871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4304  amidase  36.99 
 
 
505 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06951  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.78 
 
 
592 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5709  indole acetimide hydrolase  43.44 
 
 
484 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.49 
 
 
475 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  34.44 
 
 
1632 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  35.76 
 
 
574 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2331  amidase  39.52 
 
 
540 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0888  amidase  36.26 
 
 
568 aa  84  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3079  amidase  36.26 
 
 
567 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.83 
 
 
1806 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1616  amidase  35.71 
 
 
569 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1657  amidase  36.81 
 
 
567 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.91372  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2522  amidase  36.26 
 
 
567 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3121  amidase  38.71 
 
 
528 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2061  amidase  38.71 
 
 
528 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1318  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.64 
 
 
516 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1454  amidase  38.71 
 
 
528 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1369  amidase  38.71 
 
 
528 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3236  amidase  38.71 
 
 
528 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.595988  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  32.53 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1087  amidase  38.71 
 
 
528 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2352  amidase  38.71 
 
 
528 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2932  amidase  35.16 
 
 
567 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3257  amidase  36.26 
 
 
570 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0660  amidase  35.71 
 
 
568 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3464  amidase  35.71 
 
 
568 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2761  amidase  35.16 
 
 
584 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2760  amidase  35.16 
 
 
567 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1020  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.33 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00154188  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3287  amidase  35.71 
 
 
568 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2838  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  38 
 
 
501 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3474  indole acetimide hydrolase  43.86 
 
 
484 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.027239 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3140  amidase  34.62 
 
 
568 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.286166  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3131  amidase  35.16 
 
 
568 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3283  amidase  35.16 
 
 
584 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2368  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  38.75 
 
 
496 aa  80.1  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3331  amidase  36.67 
 
 
428 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2840  amidase  34.62 
 
 
567 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845019  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  33.7 
 
 
566 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1011  indole acetimide hydrolase  43.1 
 
 
484 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0836853 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1233  amidase  34.07 
 
 
568 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000250481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.32 
 
 
483 aa  76.6  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  38.69 
 
 
483 aa  76.3  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0058  amidase  32.43 
 
 
576 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2205  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  37.4 
 
 
499 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4089  Amidase  36.67 
 
 
497 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.447444 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119596  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A, probable  30.57 
 
 
554 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0939651  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1337  indole acetimide hydrolase  34.64 
 
 
510 aa  73.9  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000844127 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.78 
 
 
475 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10040  amidase  36.67 
 
 
569 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00301726  normal  0.910532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0927  amidase  36.67 
 
 
569 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.13 
 
 
505 aa  73.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2896  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.33 
 
 
488 aa  73.2  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  37.99 
 
 
484 aa  73.2  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2065  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.67 
 
 
485 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.700676 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  33.33 
 
 
581 aa  72.8  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.11 
 
 
491 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.3 
 
 
491 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1307  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.25 
 
 
525 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>