More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3057 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3057  amidase  100 
 
 		 513 aa  1014    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.567901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3420  amidase  61.04 
 
 		 543 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2754  Amidase  57.65 
 
 		 533 aa  428  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.518277 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  48.8 
 
 		 544 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  51.74 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1454  amidase  51.19 
 
 		 528 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2061  amidase  50.98 
 
 		 528 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3236  amidase  50.98 
 
 		 528 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.595988  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3121  amidase  50.98 
 
 		 528 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1369  amidase  50.98 
 
 		 528 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1087  amidase  50.98 
 
 		 528 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2352  amidase  50.98 
 
 		 528 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2331  amidase  51.72 
 
 		 540 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  48.69 
 
 		 536 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  46.57 
 
 		 526 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  47.1 
 
 		 540 aa  355  7.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  47.82 
 
 		 574 aa  346  7e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3426  amidase  44.4 
 
 		 520 aa  315  9e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000155871  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  40.65 
 
 		 481 aa  302  8.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  39.54 
 
 		 519 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  37.61 
 
 		 491 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  37.13 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  37.61 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  36.92 
 
 		 491 aa  279  9e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  36.71 
 
 		 491 aa  277  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  37.18 
 
 		 491 aa  276  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  36.97 
 
 		 491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  36.31 
 
 		 491 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  36.76 
 
 		 491 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  36.76 
 
 		 491 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1019  amidase  39.92 
 
 		 610 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1333  amidase  43.17 
 
 		 468 aa  268  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  37.72 
 
 		 488 aa  266  7e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  40.26 
 
 		 475 aa  262  8.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4304  amidase  39.3 
 
 		 505 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1739  amidase  36.4 
 
 		 536 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3418  amidase  36.76 
 
 		 536 aa  247  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1761  amidase  35.97 
 
 		 536 aa  246  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1957  amidase  35.88 
 
 		 536 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000744293 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1782  amidase  35.97 
 
 		 536 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  36.54 
 
 		 536 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1921  amidase  35.97 
 
 		 536 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.246226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  37.74 
 
 		 536 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2026  amidase  35.97 
 
 		 536 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00167874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2005  amidase  36.48 
 
 		 533 aa  237  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.512259  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05965  amidase  34.78 
 
 		 542 aa  228  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316578  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  36.61 
 
 		 499 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1458  Amidase  41.23 
 
 		 466 aa  219  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.249504  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  35.47 
 
 		 581 aa  219  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  33.4 
 
 		 530 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  35.81 
 
 		 519 aa  206  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  33.75 
 
 		 526 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  36.19 
 
 		 559 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  33.13 
 
 		 509 aa  192  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  34.76 
 
 		 506 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.54 
 
 		 475 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0688  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.8 
 
 		 484 aa  173  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.07 
 
 		 488 aa  170  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.82 
 
 		 499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3559  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  36.31 
 
 		 498 aa  166  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.98 
 
 		 491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  34.32 
 
 		 476 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.52 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1714  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.13 
 
 		 504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.85 
 
 		 491 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4165  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.82 
 
 		 483 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.71 
 
 		 475 aa  163  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  33.33 
 
 		 566 aa  163  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.78 
 
 		 505 aa  162  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  34.4 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2394  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.47 
 
 		 516 aa  160  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.225489  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.16 
 
 		 486 aa  159  8e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6034  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.95 
 
 		 506 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13026  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.89 
 
 		 494 aa  159  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.617428  normal  0.495008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4474  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.99 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.9 
 
 		 485 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3176  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  35.17 
 
 		 500 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1118  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  37.81 
 
 		 505 aa  158  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00327681  hitchhiker  0.000372157 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.74 
 
 		 495 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1364  amidase  32.51 
 
 		 527 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.085889  normal  0.210091 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  29.49 
 
 		 486 aa  156  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4246  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  37 
 
 		 494 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  40.27 
 
 		 1632 aa  156  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2838  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.9 
 
 		 501 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1871  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.02 
 
 		 495 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1112  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.7 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.881874  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1891  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.02 
 
 		 495 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.110583  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1580  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.78 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.24 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1937  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.02 
 
 		 495 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.846691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2489  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.32 
 
 		 490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.111465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4089  Amidase  34.49 
 
 		 497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.447444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  35.23 
 
 		 463 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.23 
 
 		 483 aa  154  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  39.58 
 
 		 1806 aa  154  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.1 
 
 		 486 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1227  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.52 
 
 		 475 aa  153  5.9999999999999996e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.2 
 
 		 508 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.71 
 
 		 483 aa  153  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2115  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.71 
 
 		 498 aa  153  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>