More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3373 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
266 aa  548  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3405  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.32 
 
 
265 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3673  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.98 
 
 
267 aa  314  9e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.23 
 
 
272 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2716  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.47 
 
 
278 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.7 
 
 
268 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132955  normal  0.0662114 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.03 
 
 
277 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.47 
 
 
278 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.09 
 
 
268 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148832  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.7 
 
 
268 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.31 
 
 
268 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.08 
 
 
278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.69 
 
 
278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3453  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.08 
 
 
278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1806  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.71 
 
 
275 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.65 
 
 
277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000145035  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.17 
 
 
279 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  52.14 
 
 
280 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.12 
 
 
281 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.12 
 
 
281 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.16 
 
 
274 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.97 
 
 
280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.19 
 
 
277 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  51.16 
 
 
275 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.78 
 
 
273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  53.12 
 
 
282 aa  265  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.34 
 
 
261 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.55 
 
 
282 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.95 
 
 
269 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.37 
 
 
269 aa  250  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223189  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.67 
 
 
268 aa  234  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0191  hypothetical protein  50.57 
 
 
311 aa  229  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.27 
 
 
271 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.97 
 
 
273 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.06 
 
 
278 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188052  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1807  hypothetical protein  43.68 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.11 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.08 
 
 
279 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3497  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.92 
 
 
275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.97 
 
 
267 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.35 
 
 
273 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
295 aa  185  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.7 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  40.17 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.49 
 
 
274 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.68 
 
 
274 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.2 
 
 
261 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  41.41 
 
 
244 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5445  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.26 
 
 
276 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620195 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.52 
 
 
276 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00756202  normal  0.114208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  38.4 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.7 
 
 
278 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.08 
 
 
278 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 
272 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02700  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.98 
 
 
270 aa  138  7.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.262568  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 
277 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.12 
 
 
273 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.77 
 
 
247 aa  122  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1140  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.64 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
560 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
277 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.07 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
249 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.91 
 
 
263 aa  108  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
252 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
283 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
249 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
299 aa  86.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.91 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
303 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.243124  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2697  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
305 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
292 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
310 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
310 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.4 
 
 
297 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.199169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
310 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 
313 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
312 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
375 aa  62.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
297 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.55 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
325 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>