77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1469 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  100 
 
 		 225 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  61.78 
 
 		 210 aa  297  7e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  59.91 
 
 		 208 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  60 
 
 		 210 aa  285  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  58.67 
 
 		 210 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  57.14 
 
 		 214 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  60 
 
 		 210 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  59.56 
 
 		 210 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  54.19 
 
 		 217 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  53.1 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  52.86 
 
 		 210 aa  241  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  52.86 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  52.17 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  55.11 
 
 		 224 aa  228  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  55.11 
 
 		 214 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  51.53 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  58.15 
 
 		 225 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  54.63 
 
 		 218 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  54.63 
 
 		 218 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  60.35 
 
 		 215 aa  218  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  57.27 
 
 		 225 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  50 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  42.34 
 
 		 209 aa  188  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  41.44 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  44.69 
 
 		 208 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  38.74 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  41.03 
 
 		 421 aa  85.1  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  28.02 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  28.19 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  25.43 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  32.67 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  35.4 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  26.23 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  33.96 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2209  putative phage repressor  35.48 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111819 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  37.14 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  32.69 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  35.71 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  26.39 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  26.39 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  26.39 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  23.92 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  25.11 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  29.46 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  37.35 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  30.83 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  31.25 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  29.41 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  32.41 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  28.57 
 
 		 261 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  39.19 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  32.61 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  32.14 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  32.95 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  24.81 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  35.53 
 
 		 120 aa  45.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  37.21 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  32.95 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  34.83 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  30.15 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  25.56 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  26.45 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.16 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  28.41 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  27.23 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  24.73 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  20.83 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  19.63 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  32.14 
 
 		 265 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  27.78 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 283 aa  42  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 204 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>