More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2216 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2216  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 250 aa  490  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108456  normal  0.474426 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  41.39 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4464  regulatory protein, IclR  41.15 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1720  IclR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.078554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  38.63 
 
 		 241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  37.96 
 
 		 282 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 277 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  34.63 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  34.29 
 
 		 290 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  36.22 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 269 aa  92.8  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 288 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  30.96 
 
 		 275 aa  89.4  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  32.46 
 
 		 253 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  34.18 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 		 286 aa  85.5  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  24.69 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  28.69 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  29.22 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  30.48 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  29.65 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  31.52 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0258  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5383  IclR family transcriptional regulator family  30.95 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.92 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  39.67 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3604  IclR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.83328  normal  0.323087 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  38.24 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0796  IclR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3865  HTH-type transcriptional regulator  26.89 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.16 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3881  hth-type tranScriptional regulator yiaj  26.89 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4051  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  26.89 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.726111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3990  hth-type tranScriptional regulator yiaj  26.89 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3945  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  26.89 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.650339 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  26.79 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  26.79 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  26.79 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3614  transcriptional regulator, IclR family  27.64 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.149687  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  24.48 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  26.79 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  24.58 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  29.61 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  23.67 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 249 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1115  transcriptional regulator, IclR family  29.81 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  28.76 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  30.6 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  22.86 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2558  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  25.93 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  27.92 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3937  transcriptional regulator, IclR family  33.59 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8163  transcriptional regulator IclR family  25.26 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0684047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  26.56 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  23.75 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  24.69 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>