150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1628 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1628  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 270 aa  544  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0331931  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1438  polysaccharide deacetylase  68.91 
 
 		 278 aa  364  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2784  polysaccharide deacetylase  64.77 
 
 		 293 aa  356  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  hitchhiker  0.00301468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1803  polysaccharide deacetylase  68.91 
 
 		 255 aa  353  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000258009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3158  polysaccharide deacetylase  65.5 
 
 		 285 aa  347  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5006  polysaccharide deacetylase  66.27 
 
 		 272 aa  342  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1185  polysaccharide deacetylase  64.43 
 
 		 279 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.471915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1105  polysaccharide deacetylase  64.43 
 
 		 278 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2080  putative polysaccharide deacetylase  66.24 
 
 		 271 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1081  polysaccharide deacetylase  53.33 
 
 		 277 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1253  lipoprotein signal peptide  52.4 
 
 		 273 aa  279  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1173  polysaccharide deacetylase  53.56 
 
 		 276 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2063  polysaccharide deacetylase  52.08 
 
 		 283 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2067  polysaccharide deacetylase  50.63 
 
 		 291 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1259  polysaccharide deacetylase  46.22 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226981  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  25.74 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.63 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.27 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.41 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  24.77 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  25.32 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.03 
 
 		 571 aa  63.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  27 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  25.97 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  24.11 
 
 		 404 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.57 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  25 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.97 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.97 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.97 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.97 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  23.23 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  27.16 
 
 		 520 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.09 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.54 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  27 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  25.99 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  24.03 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  25.24 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  27.06 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  22.44 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  24.11 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  25.12 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  24.74 
 
 		 413 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0450  polysaccharide deacetylase  24.54 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000380571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 294 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  25.46 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 294 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  22.46 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  23.64 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  26.03 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  23.93 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 		 287 aa  52.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 		 297 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  22.87 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 		 354 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  24.57 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  26.61 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  25.11 
 
 		 503 aa  50.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  23.39 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 		 335 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 372 aa  49.3  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  26.61 
 
 		 275 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  23.96 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1758  polysaccharide deacetylase family protein  33.68 
 
 		 320 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00010235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  24.17 
 
 		 213 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 		 324 aa  48.9  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  24.59 
 
 		 372 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>