95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0116 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0116  hemagglutinin/protease regulatory protein  100 
 
 		 68 aa  141  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03459  hypothetical protein  92.42 
 
 		 205 aa  123  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2619  HTH-type luminescence regulator LitR  85.71 
 
 		 201 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002553  quorum-sensing regulator of virulence HapR  97.73 
 
 		 183 aa  93.6  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  43.64 
 
 		 204 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 226 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 237 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 202 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 388 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 219 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 197 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 222 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 248 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 221 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 195 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 200 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  38 
 
 		 278 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  35.94 
 
 		 220 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 215 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 242 aa  42.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  38.18 
 
 		 237 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  34.33 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 246 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 237 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  31.75 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 236 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 254 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 222 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 205 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 205 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 194 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 222 aa  41.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 205 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  33.87 
 
 		 219 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 203 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 205 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 201 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 201 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 201 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 239 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 212 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 213 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 242 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 227 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 219 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 223 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 218 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 204 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 220 aa  40.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 197 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 308 aa  40  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 209 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 252 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 196 aa  40  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 194 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 196 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 210 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 196 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 196 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 196 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 196 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 196 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>