More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1866 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  414  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  32.63 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 451 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 428 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 451 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  29.88 
 
 		 390 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  51.6  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 424 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2454  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 242 aa  51.6  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  31.03 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  41.56 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 446 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  28.7 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 330 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 309 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  37.8 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>