More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1832 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  274  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  32.54 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  44.64 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  39.34 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 197 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  36 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  24.07 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  26.88 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  23.94 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  22.92 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  31.13 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  25.21 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  29.58 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  28.44 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 155 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  32.39 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  21.19 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 174 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  33.33 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 		 180 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  31.18 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  26.37 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  20 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 220 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  28.85 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  29.58 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  30 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  23.75 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  20.37 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  25.27 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  22.88 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  33.33 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>