172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2323 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  51.59 
 
 
800 aa  743    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 
778 aa  1555    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  42.24 
 
 
807 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  35.52 
 
 
821 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  34.17 
 
 
821 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  35.54 
 
 
784 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  33.82 
 
 
765 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  32.06 
 
 
776 aa  332  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  31.86 
 
 
804 aa  330  4e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  33.5 
 
 
800 aa  327  7e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  30.39 
 
 
858 aa  319  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  35.77 
 
 
772 aa  318  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  31.89 
 
 
836 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  32.84 
 
 
822 aa  306  6e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  29.75 
 
 
777 aa  289  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  32.68 
 
 
820 aa  286  8e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  29.48 
 
 
864 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  32.11 
 
 
721 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  29.77 
 
 
856 aa  252  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  30.2 
 
 
783 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.23 
 
 
724 aa  210  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  26.93 
 
 
825 aa  207  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  31.15 
 
 
834 aa  206  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  27.3 
 
 
904 aa  205  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  26.49 
 
 
731 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  30.42 
 
 
733 aa  198  4.0000000000000005e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  27.96 
 
 
801 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.44 
 
 
717 aa  197  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 
745 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  25.65 
 
 
829 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  25.66 
 
 
792 aa  191  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  31.9 
 
 
667 aa  190  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  27.49 
 
 
781 aa  189  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.55 
 
 
724 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  30.8 
 
 
730 aa  186  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  28.01 
 
 
739 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  26.68 
 
 
1084 aa  185  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25 
 
 
751 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.84 
 
 
794 aa  181  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  25.63 
 
 
753 aa  180  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 
728 aa  178  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  23.77 
 
 
782 aa  178  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  25.43 
 
 
722 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  24.13 
 
 
740 aa  177  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  24.31 
 
 
805 aa  177  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  25.52 
 
 
745 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  26.86 
 
 
939 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.34 
 
 
744 aa  173  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  22.9 
 
 
759 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  24.72 
 
 
732 aa  171  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.15 
 
 
692 aa  171  7e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 
772 aa  171  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  24.68 
 
 
732 aa  170  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  25.62 
 
 
1078 aa  169  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  24.35 
 
 
722 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.19 
 
 
752 aa  167  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  26.89 
 
 
661 aa  163  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.97 
 
 
824 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  30.54 
 
 
651 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  32.52 
 
 
792 aa  135  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  30.02 
 
 
880 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  28.87 
 
 
738 aa  111  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  21.2 
 
 
779 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  23.87 
 
 
747 aa  108  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2186  CRISPR-associated HD domain protein  22.02 
 
 
729 aa  107  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  30.29 
 
 
737 aa  104  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  25.3 
 
 
794 aa  104  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  25.4 
 
 
763 aa  103  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  21.78 
 
 
781 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  23.71 
 
 
905 aa  100  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1171  CRISPR-associated HD domain-containing protein  28.27 
 
 
316 aa  100  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  26.31 
 
 
741 aa  99.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  21.43 
 
 
783 aa  98.6  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  25.47 
 
 
804 aa  97.4  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  23.33 
 
 
750 aa  97.1  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  24.42 
 
 
899 aa  96.3  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  24.29 
 
 
762 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  24.69 
 
 
750 aa  92.8  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  24.75 
 
 
850 aa  90.1  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  24.59 
 
 
729 aa  89  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  24.49 
 
 
794 aa  88.2  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  24.87 
 
 
843 aa  87.4  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  26.95 
 
 
775 aa  86.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  26.77 
 
 
726 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  26.54 
 
 
736 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  25.51 
 
 
795 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  24.41 
 
 
854 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  24.29 
 
 
729 aa  82.4  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  25.51 
 
 
744 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  23.31 
 
 
801 aa  79.7  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  20.5 
 
 
1027 aa  79  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  20.2 
 
 
929 aa  79.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.28 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  24.66 
 
 
741 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  26.33 
 
 
917 aa  77.4  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  22.39 
 
 
566 aa  77  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  23.54 
 
 
811 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  24.46 
 
 
799 aa  76.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  28.97 
 
 
764 aa  75.1  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  21.05 
 
 
919 aa  73.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.390014 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>