155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2091 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 
338 aa  662    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  30.35 
 
 
337 aa  159  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  29.36 
 
 
331 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  28.99 
 
 
334 aa  146  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  28.53 
 
 
329 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  30.24 
 
 
330 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  30.42 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  28.82 
 
 
329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  30.24 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  33.44 
 
 
342 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  32.53 
 
 
339 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  28.83 
 
 
344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  30.89 
 
 
337 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  28 
 
 
335 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  26.84 
 
 
338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  26.93 
 
 
324 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  28.07 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  27.71 
 
 
348 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  29.39 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  27.19 
 
 
330 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  30.42 
 
 
348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  30.54 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  30.12 
 
 
348 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  29.69 
 
 
325 aa  112  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  27.54 
 
 
336 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  27.71 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  27.71 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  27.71 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  27.78 
 
 
336 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  27.41 
 
 
336 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  27.41 
 
 
336 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  27.11 
 
 
336 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  27.41 
 
 
336 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  23.38 
 
 
338 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  26.51 
 
 
336 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  23.48 
 
 
332 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  26.75 
 
 
336 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  23.78 
 
 
315 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  22.84 
 
 
354 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  25.9 
 
 
336 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 
306 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  21.45 
 
 
350 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  24.41 
 
 
342 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  23.55 
 
 
325 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  23.58 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  25.6 
 
 
333 aa  93.6  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  23.3 
 
 
419 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  23.49 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  23.38 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  25.52 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  23.63 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  23.72 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  26.33 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  23.94 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  26.55 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  25.31 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  25.31 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  24.55 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  24.55 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  22.45 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  23.27 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  25.86 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368  hypothetical protein  26.17 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.42314e-33  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  24.71 
 
 
339 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  24.42 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  24.75 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  23.22 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  21.86 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  22.12 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  25.29 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  21.7 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  26.69 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  24.14 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  24.34 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  25.08 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  26.69 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  21.99 
 
 
344 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2001  DNA polymerase III, delta subunit  22.86 
 
 
341 aa  63.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  25.29 
 
 
311 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  20.87 
 
 
325 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  20.92 
 
 
323 aa  63.2  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  20.69 
 
 
328 aa  62.8  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  21.95 
 
 
345 aa  62  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  18.96 
 
 
344 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  23.46 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  21.47 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1451  DNA polymerase III subunit delta  18.3 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0184698  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  23.27 
 
 
312 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  21.49 
 
 
335 aa  61.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  19.7 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.08 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  20.23 
 
 
345 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  21.66 
 
 
332 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  25.56 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0234  DNA polymerase III, delta subunit  19.94 
 
 
353 aa  57  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0402  DNA polymerase III, delta subunit  18.87 
 
 
338 aa  57  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.745977  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0671  DNA polymerase III, delta subunit  20.99 
 
 
339 aa  56.6  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00374825  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1508  DNA polymerase III, delta subunit  20.99 
 
 
339 aa  56.6  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0182978  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  22.26 
 
 
331 aa  56.2  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>