More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3931 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
224 aa  460  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  59.09 
 
 
236 aa  288  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  57.41 
 
 
222 aa  274  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  55.45 
 
 
229 aa  265  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.15 
 
 
251 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 
275 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  34.83 
 
 
220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 
368 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 
275 aa  128  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 
275 aa  128  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 
275 aa  128  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  33.99 
 
 
275 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 
275 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 
276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
241 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
275 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  34.54 
 
 
1099 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 
405 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  32.49 
 
 
317 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
258 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  33.83 
 
 
244 aa  121  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  33.83 
 
 
217 aa  121  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  34.34 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.33 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.82 
 
 
241 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  34.85 
 
 
373 aa  118  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  30.23 
 
 
295 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  33.64 
 
 
479 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 
387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
299 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
264 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 
302 aa  116  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 
479 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 
404 aa  115  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
215 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  33.18 
 
 
481 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 
277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  32.85 
 
 
301 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 
465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
283 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 
320 aa  113  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  32.64 
 
 
279 aa  113  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 
305 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  35.27 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 
217 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  32.82 
 
 
240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.17 
 
 
1115 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  33.17 
 
 
927 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.17 
 
 
1115 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  33.17 
 
 
1115 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  33.17 
 
 
1119 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  34.25 
 
 
364 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 
752 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1948  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
249 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000715916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  38.12 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  32.93 
 
 
327 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  31.1 
 
 
317 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 
221 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.97 
 
 
1115 aa  108  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.47 
 
 
250 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 
413 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  32.49 
 
 
264 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  29.22 
 
 
247 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 
212 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 
204 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 
259 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
256 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 
244 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  28.86 
 
 
235 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  32.2 
 
 
872 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 
503 aa  105  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 
204 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  33.89 
 
 
227 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
199 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 
232 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  31.74 
 
 
240 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 
258 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  35.37 
 
 
259 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  30.43 
 
 
417 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  31.74 
 
 
321 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
324 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 
537 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.06 
 
 
573 aa  102  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  32.6 
 
 
244 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 
522 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1228  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
327 aa  101  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>